Il s'agit de l'application Linux nommée SPSens dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom SPSensbeta.3.4.tgz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée SPsens avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SPens
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DESCRIPTION
SPSens est un progiciel complet écrit en C qui estime les sensibilités des paramètres pour les modèles stochastiques de réseaux de réactions chimiques et biochimiques à l'aide de simulations stochastiques de Monte Carlo (MC). Il est possible d'estimer les sensibilités vis-à-vis des paramètres du système à l'aide des algorithmes suivants : méthodes aux différences finies (monte carlo brut, chemin de réaction commun, différences finies couplées) ; méthodes de rapport de vraisemblance; et les dérivées de cheminement régularisées.
De plus, le package comprend des algorithmes de simulation stochastiques de base. Le package comprend plusieurs exemples de réseaux qui peuvent être facilement modifiés pour d'autres réseaux.
Les implémentations MPI série et parallèle peuvent être construites et appelées à partir de la ligne de commande. L'implémentation série du package peut également être appelée depuis Matlab via l'interface MEX avec des fonctionnalités limitées. Il prend en charge de nombreuses options spécifiées par l'utilisateur, y compris l'utilisation d'un échantillonnage antithétique qui peut être utilisé dans certains cas pour augmenter l'efficacité.
Audience
Sciences/Recherche, Ingénierie
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/spsens/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
