Il s'agit de l'application Windows AmPEP et AxPEP, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom deep-ampep30-test_set.zip. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée AmPEP et AxPEP avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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AmPEP et AxPEP
DESCRIPTION
Les peptides antimicrobiens (AMP) sont des candidats prometteurs dans la lutte contre les agents pathogènes multirésistants en raison de leur large éventail d'activités et de leur faible toxicité. Cependant, l'identification des AMP par une expérience en laboratoire humide est encore coûteuse et prend du temps. AmPEP est une méthode de calcul précise pour la prédiction AMP utilisant l'algorithme de forêt aléatoire. Le modèle de prédiction est basé sur les modèles de distribution des propriétés des acides aminés le long de la séquence. Notre modèle optimal, AmPEP avec un rapport de données de 1:3 a atteint une très haute précision de 96%, MCC de 0.9, AUC-ROC de 0.99 et statistique Kappa de 0.9. AmPEP surpasse les méthodes existantes en ce qui concerne la précision, le MCC et l'AUC-ROC lorsqu'il est testé à l'aide des ensembles de données de référence.Fonctionnement
- code source MATLAB
- Ensembles de données AmPEP
- Apprentissage automatique
- Bioinformatique
- Séquence peptidique
- Découverte de médicament
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/axpep/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
