Il s'agit de l'application Windows nommée HeatmapGenerator dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom HeatmapGenerator5_MacOSX.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée HeatmapGenerator avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Générateur de cartes thermiques
DESCRIPTION
HeatmapGenerator est un logiciel d'interface utilisateur graphique écrit en C++, R et OpenGL pour créer des cartes thermiques d'expression génique personnalisées à partir de données RNA-seq et de microarrays dans la recherche médicale. HeatmapGenerator peut également être utilisé pour créer des cartes thermiques dans une variété d'autres domaines non médicaux.
HeatmapGenerator est un logiciel publié évalué par des pairs (http://www.scfbm.org/content/9/1/30). Veuillez citer : [Khomtchouk et al. : « HeatmapGenerator : Suite logicielle de visualisation RNAseq et microarray haute performance pour examiner les niveaux d'expression génétique différentiels à l'aide d'un pipeline de calcul hybride R et C++ ». Code source pour la biologie et la médecine, 2014 9:30]
Le code source de HeatmapGenerator est disponible sur : https://github.com/Bohdan-Khomtchouk/HeatmapGenerator
Bohdan Khomtchouk souhaite remercier le ministère de la Défense (DoD) pour son soutien dans le cadre du programme National Defence Science & Engineering Graduate Fellowship (NDSEG).
HeatmapGenerator est publié sous la GNU GPL.
Fonctionnalités:
- Langage de programmation C ++
- Langage de programmation R
- Interface utilisateur graphique FLTK
- OpenGL : la base de l'industrie pour les graphiques hautes performances
Interface utilisateur
OpenGL, FLTK, Carbone (Mac OS X)
Langage de programmation
C++, S/R
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/heatmapgenerator/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
