Il s'agit de l'application Windows MS2Browser, compatible avec Windows en ligne, sur Linux en ligne. Sa dernière version est téléchargeable sous le nom de MS2Browser.zip. Elle est également disponible en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MS2Browser pour l'exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MS2Browser fonctionnera sous Windows en ligne plutôt que sous Linux en ligne
DESCRIPTION
MS2Browser est un outil interactif de prétraitement, d'analyse et de visualisation des données LC-MS/MS. L'entrée est un fichier mzXML contenant des données LC-MS/MS centroïdes. Le programme, écrit en MatLab, a été conçu pour l'analyse des sidérophores (petites molécules transportant le fer) en milieu bactérien. Certaines fonctionnalités et utilisations de MS2Browser sont décrites dans un chapitre d'ouvrage en libre accès :http://www.intechopen.com/books/applications-from-engineering-with-matlab-concepts/small-molecule-lc-ms-ms-fragmentation-data-analysis-and-application-to-siderophore-identification
Une base de données structurelles de sidérophores assemblée pour ce projet peut être trouvée à côté du logiciel MS2Browser (format .cfw à utiliser avec ChemBioFinder(TM)).
REMARQUE : Ce programme est conçu pour un usage personnel afin de faciliter l'analyse des sidérophores à l'aide de données LC-MS/MS haute résolution. N'hésitez pas à me contacter pour toute question concernant son utilisation, les bugs, etc.
Comment ça marche
- Analyse des données LC-MS/MS de petites molécules
- Recherche de fragments d'ions et de pertes neutres, réseaux de similarité MS/MS, auto-convolution MS/MS
- Visualisation des chromatogrammes et des spectres
- Analyse des sidérophores à l'aide d'une approche d'auto-convolution MS/MS
- Base de données structurelles des sidérophores dans ChemBioFinder(TM)
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
MATLAB
Cette application peut également être téléchargée depuis https://sourceforge.net/projects/ms2browser/. Elle est hébergée sur OnWorks afin de pouvoir être exécutée en ligne plus facilement depuis l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
