Il s'agit de l'application Windows nommée RASPnmr qui s'exécute sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous RASP-0.1.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée RASPnmr pour exécuter gratuitement Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
RASPnmr pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
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DESCRIPTION
RASP utilise des prédictions de déplacement chimique basées sur la structure pour résoudre le problème d'attribution de la résonance du squelette dans la spectroscopie RMN des protéines. Cela permet de déterminer rapidement des affectations très précises sur la base d'ensembles de données expérimentales minimales, même pour les protéines spectroscopiquement difficiles.RASP prend en entrée des systèmes de spin assemblés sur la base d'un ensemble arbitraire d'expériences conventionnelles de RMN à triple résonance. De manière unique, RASP est capable d'attributions étendues même en l'absence d'informations sur le déplacement chimique Cbeta : sur un ensemble de tests de 154 protéines, RASP attribue 88 % des résidus avec une précision de 99.7 %, en utilisant uniquement les informations disponibles à partir des spectres HNCO et HNCA.
RASP est décrit ici :
MacRaild et Norton (2014) RASP : affectations rapides et robustes du déplacement chimique du squelette à partir de la structure des protéines. J Biomol RMN doi:10.1007/s10858-014-9813-7
Audience
Science/Recherche, Utilisateurs finaux avancés
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Python
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/raspnmr/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.