bp_run_protdist.plp - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

run_neighbor - बायोपरल के माध्यम से फ़िलिप का 'प्रोटिडिस्ट' प्रोग्राम चलाएँ

SYNOPSIS

run_protdist [-i इनपुटफ़ाइल] [-o आउटफ़ाइलनाम]

वर्णन

प्रोटिस्ट को चलाने के लिए एक संरेखण फ़ाइल प्रदान करें। फ़ाइल का नाम या तो .aln या .phy होना चाहिए।
यह आवश्यक है ताकि हम यह निर्धारित कर सकें कि क्या हमें क्लस्टर संरेखण को इसमें परिवर्तित करने की आवश्यकता है
फ़िलिप. अन्य एमएसए प्रारूपों पर काम करने के लिए स्क्रिप्ट का विस्तार करने के लिए आपका स्वागत है जो बायोपरल है
समर्थन करता है. इसका उद्देश्य बहुत ही सरल मैनुअल पाइपलाइनों में उपयोग करना है।

इनपुट फ़ाइल को file.phy या file.aln के रूप में नामित किया जाना चाहिए, प्रोग्राम अपेक्षा करता है
(\S+)\.(\S+) के रूप में फ़ाइल करें।

यह प्रोटीन बनाने के लिए 'किमुरा' फॉर्मूले का उपयोग करके 'प्रोटिडिस्ट' एप्लिकेशन चलाएगा
दूरी मैट्रिक्स. यदि philip3.6 वाले लोग उपयोग करना चाहते हैं तो वे कुछ परिवर्तन करना चाहेंगे
जेटीटी. यदि अनुरोध किया जाता है तो मुझे इसे सीएमडी-लाइन तर्क के रूप में जोड़ने में मदद करने में खुशी होगी।

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