fdnadiste - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

fdnadist - न्यूक्लिक एसिड अनुक्रम दूरी मैट्रिक्स कार्यक्रम

SYNOPSIS

fdnadist -अनुक्रम सेक्सेटल -तरीका सूची -गामा सूची -nश्रेणियां पूर्णांक -मूल्यांकन करें सरणी
-श्रेणियाँ गुण [-वजन गुण] -गामा गुणांक नाव
-इनवारफ्रैक नाव -tratio नाव -freqsfrom टॉगल -बेसफ्रीक सरणी
[-निचला बूलियन] [-पठनीय मानव बूलियन] -आउटफाइल आउटफाइल [-प्रिंटडेटा बूलियन]
[-प्रगति बूलियन]

fdnadist -मदद

वर्णन

fdnadist EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "फाइलोजेनी: आण्विक अनुक्रम" कमांड समूह का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-अनुक्रम सेक्सेटल
एक या अधिक अनुक्रम संरेखण वाली फ़ाइल

-तरीका सूची
डिफ़ॉल्ट मान: F84 दूरी मॉडल

-गामा सूची
डिफ़ॉल्ट मान: कोई वितरण पैरामीटर उपयोग नहीं किया गया

-nश्रेणियां पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-मूल्यांकन करें सरणी
डिफ़ॉल्ट मान: 1.0

-श्रेणियाँ गुण
प्रतिस्थापन दर श्रेणियों की फ़ाइल

-वजन गुण

अतिरिक्त अनुभाग
-गामा गुणांक नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-इनवारफ्रैक नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 0.0

-tratio नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 2.0

-freqsfrom टॉगल
डिफ़ॉल्ट मान: Y

-बेसफ्रीक सरणी
डिफ़ॉल्ट मान: 0.25 0.25 0.25 0.25

-निचला बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-पठनीय मानव बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: @($(विधि)==s?Y:N)

उत्पादन अनुभाग
-आउटफाइल आउटफाइल

-प्रिंटडेटा बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-प्रगति बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: Y

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