fill-ref-md5 - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

fill-ref-md5 - संदर्भ अनुक्रम के MD5 योग की गणना करता है

SYNOPSIS

भरण-रेफ-एमडी5 [विकल्प] in.vcf.gz out.vcf.gz

वर्णन

के बारे में: स्क्रिप्ट संदर्भ अनुक्रम और आवेषण के एमडी5 योग की गणना करती है

VCFv4.1 द्वारा अनुशंसित हेडर में 'संदर्भ' और 'कॉन्टिग' टैग। वीसीएफ फ़ाइल
इसे संपीड़ित और टैबिक्स अनुक्रमित किया जाना चाहिए, क्योंकि यह बिजली की तेजी का लाभ उठाता है
टैबिक्स रिहेडर कार्यक्षमता।

विकल्प

-d, --शब्दकोश
परिकलित MD5 को कहां पढ़ें/लिखें। परिशिष्ट मोड में खोले गए, मौजूदा रिकॉर्ड नहीं हैं
छुआ।

-i, --जानकारी
संदर्भ संयोजन (एएस), प्रजाति (एसपी), वर्गीकरण (टीएक्स) पर वैकल्पिक जानकारी

-r, --refseq
फास्टा प्रारूप में संदर्भ अनुक्रम samtools faidx द्वारा अनुक्रमित है

-h, -?, --मदद
यह मदद संदेश।

उदाहरण

fill-ref-md5 -i AS:NCBIM37,SP:"मस\ मस्कुलस" -rNCIM37_um.fa
-डी एनसीबीआईएम37_उम.एफए.डिक्ट इन.वीसीएफ.जीजेड आउट.वीसीएफ.जीजेड

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