fpromlke - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

fpromlk - अधिकतम संभावना से प्रोटीन फ़ाइलोजेनी

SYNOPSIS

fpromlk -अनुक्रम सेक्सेटल -इनट्रीफाइल पेड़ [-nश्रेणियां पूर्णांक] -मूल्यांकन करें सरणी
-श्रेणियाँ गुण [-वजन गुण] -लंबाई बूलियन [-आदर्श सूची]
[-गामा सूची] -गामा गुणांक नाव -नगम्माकाट पूर्णांक -अवर गुणांक नाव
-निनवारकाट पूर्णांक -इनवारफ्रैक नाव -एनएचएमएम श्रेणियां पूर्णांक -हम्म्रेट्स सरणी
-हम्मसंभावना सरणी -adjsite बूलियन -लैम्ब्डा नाव -नजंबल पूर्णांक
बीज पूर्णांक ग्लोबल बूलियन [-आउटग्रोनो पूर्णांक] -आउटफाइल आउटफाइल [-ट्राउट टॉगल]
-आउटट्रीफाइल आउटफाइल [-प्रिंटडेटा बूलियन] [-प्रगति बूलियन] [-ट्रीप्रिंट बूलियन]
[-हाइपस्टेट बूलियन]

fpromlk -मदद

वर्णन

fpromlk EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "फाइलोजेनी: आण्विक अनुक्रम" कमांड समूह का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-अनुक्रम सेक्सेटल
एक या अधिक अनुक्रम संरेखण वाली फ़ाइल

-इनट्रीफाइल पेड़

-nश्रेणियां पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-मूल्यांकन करें सरणी

-श्रेणियाँ गुण

-वजन गुण

अतिरिक्त अनुभाग
-लंबाई बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-आदर्श सूची
डिफ़ॉल्ट मान: जोन्स-टेलर-थॉर्नटन

-गामा सूची
डिफ़ॉल्ट मान: n

-गामा गुणांक नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-नगम्माकाट पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-अवर गुणांक नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-निनवारकाट पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-इनवारफ्रैक नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 0.0

-एनएचएमएम श्रेणियां पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

-हम्म्रेट्स सरणी
डिफ़ॉल्ट मान: 1.0

-हम्मसंभावना सरणी
डिफ़ॉल्ट मान: 1.0

-adjsite बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-लैम्ब्डा नाव
डिफ़ॉल्ट मान: 1.0

-नजंबल पूर्णांक

बीज पूर्णांक
डिफ़ॉल्ट मान: 1

ग्लोबल बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-आउटग्रोनो पूर्णांक

उत्पादन अनुभाग
-आउटफाइल आउटफाइल

-ट्राउट टॉगल
डिफ़ॉल्ट मान: Y

-आउटट्रीफाइल आउटफाइल

-प्रिंटडेटा बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-प्रगति बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: Y

-ट्रीप्रिंट बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: Y

-हाइपस्टेट बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

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