फ़ज़न्यूज़ - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

फ़ज़्नुक - न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों में पैटर्न की खोज करें

SYNOPSIS

फ़ज़्नुक -अनुक्रम Seqall -पटना पैटर्न -पूरक बूलियन -आउटफाइल रिपोर्ट

फ़ज़्नुक -मदद

वर्णन

फ़ज़्नुक EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "न्यूक्लिक: मोटिफ़्स" कमांड समूह का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-अनुक्रम Seqall

-पटना पैटर्न
न्यूक्लियोटाइड्स के लिए मानक IUPAC एक-अक्षर कोड का उपयोग किया जाता है। प्रतीक 'एन' है
ऐसी स्थिति के लिए उपयोग किया जाता है जहां कोई भी न्यूक्लियोटाइड स्वीकार किया जाता है। अस्पष्टताओं का संकेत मिलता है
किसी दिए गए स्थान के लिए स्वीकार्य न्यूक्लियोटाइड को वर्गाकार कोष्ठकों के बीच सूचीबद्ध करना '[
]'. उदाहरण के लिए: [एसीजी] का मतलब ए या सी या जी है। अस्पष्टताएं भी इसके द्वारा इंगित की जाती हैं
घुंघराले कोष्ठक '{ }' की एक जोड़ी के बीच उन न्यूक्लियोटाइडों को सूचीबद्ध करना जिन्हें स्वीकार नहीं किया जाता है
किसी दिए गए पद पर. उदाहरण के लिए: {AG} का मतलब A और G को छोड़कर किसी भी न्यूक्लियोटाइड से है
एक पैटर्न में तत्व को उसके पड़ोसी से '-' द्वारा अलग किया जाता है। (फ़ज़्नुक में वैकल्पिक)।
पैटर्न के किसी तत्व की पुनरावृत्ति को उस तत्व का अनुसरण करके दर्शाया जा सकता है
संख्यात्मक मान या कोष्ठक के बीच संख्यात्मक सीमा के साथ। उदाहरण: N(3)
एनएनएन से मेल खाता है, एन(2,4) एनएन या एनएनएन या एनएनएनएन से मेल खाता है। जब एक पैटर्न है
किसी अनुक्रम के 5' या 3' अंत तक ही सीमित, वह पैटर्न या तो a से शुरू होता है
'<' प्रतीक या क्रमशः '>' प्रतीक के साथ समाप्त होता है। एक अवधि पैटर्न को समाप्त करती है।
(फ़ज़्नुक में वैकल्पिक)। उदाहरण के लिए, [सीजी](5)टीजी{ए}एन(1,5)सी

उन्नत अनुभाग
-पूरक बूलियन
डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

उत्पादन अनुभाग
-आउटफाइल रिपोर्ट

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके फ़ज़न्यूज़ का ऑनलाइन उपयोग करें