जीएमएक्स-सैक्स - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

जीएमएक्स-सैक्स - छोटे कोण वाले एक्स-रे प्रकीर्णन स्पेक्ट्रा की गणना करें

SYNOPSIS

जीएमएक्स सैक्स [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr/.gro/...>]] [-n [<.ndx>]]
[-d [<.डेट>]] [-वर्ग [<.xvg>]] [-b ] [-e ]
[-डीटी ] [-xvg ] [-एनजीओ ] [-स्टार्टक्यू ]
[-एंडक्यू ] [-ऊर्जा ]

वर्णन

GMX सैक्स क्रॉमर के आधार पर दिए गए सूचकांक समूहों के लिए SAXS संरचना कारकों की गणना करता है
तरीका। टोपोलॉजी और प्रक्षेपवक्र दोनों फ़ाइलें आवश्यक हैं।

विकल्प

इनपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:

-f [<.xtc/.trr/...>] (ट्रेज.एक्सटीसी)
प्रक्षेपवक्र: परमानंद ट्र्र CPT gro g96 पीडीबी TNG

-s [<.tpr/.gro/...>] (टॉपोल.टीपीआर)
संरचना + द्रव्यमान (डीबी): TPR gro g96 पीडीबी बीआरके ENT

-n [<.ndx>] (index.ndx) (वैकल्पिक)
अनुक्रमणिका फ़ाइल

-d [<.डेट>] (sfactor.dat) (वैकल्पिक)
सामान्य डेटा फ़ाइल

आउटपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:

-वर्ग [<.xvg>] (वर्ग xvg)
xvgr/xmgr फ़ाइल

अन्य विकल्प:

-b (0)
प्रक्षेपवक्र से पढ़ने के लिए पहला फ्रेम (पीएस)

-e (0)
प्रक्षेपवक्र से पढ़ने के लिए अंतिम फ्रेम (पीएस)

-डीटी (0)
केवल फ्रेम का उपयोग करें जब टी एमओडी डीटी = पहली बार (पीएस)

-xvg
xvg प्लॉट स्वरूपण: xmgrace, xmgr, कोई नहीं

-एनजीओ (1)
SAXS की गणना करने के लिए समूहों की संख्या

-स्टार्टक्यू (0)
प्रारंभिक क्यू (1/एनएम)

-एंडक्यू (60)
समाप्ति क्यू (1/एनएम)

-ऊर्जा (12)
आने वाली एक्स-रे की ऊर्जा (keV)

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके gmx-saxs का ऑनलाइन उपयोग करें