यह कमांड hmm2fetch है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
hmm2fetch - HMM डेटाबेस से HMM पुनर्प्राप्त करें
SYNOPSIS
हम्म2फ़ेच [विकल्प] डेटाबेस नाम
वर्णन
हम्म2फ़ेच एक छोटी उपयोगिता है जो HMM नामक को पुनः प्राप्त करती है नाम HMMER मॉडल डेटाबेस से
बुलाया डेटाबेस। एक नए प्रारूप में, और उस मॉडल को मानक आउटपुट पर प्रिंट करता है। उदाहरण के लिए,
हम्म2फ़ेच Pfam RRM Pfam से RRM (RNA रिकग्निशन मोटिफ) मॉडल को पुनः प्राप्त करता है, यदि
पर्यावरण चर HMMERDB को Pfam डेटाबेस के स्थान पर सेट किया गया है। पुनर्प्राप्त
HMM फ़ाइल HMMER 2 ASCII प्रारूप में लिखी गई है।
डेटाबेस में एक संबद्ध GSI इंडेक्स फ़ाइल होनी चाहिए. HMM डेटाबेस को अनुक्रमित करने के लिए, इसका उपयोग करें
कार्यक्रम हम्म2सूचकांक.
विकल्प
-h संक्षिप्त सहायता प्रिंट करें; संस्करण संख्या और सभी विकल्पों का सारांश शामिल है, जिसमें शामिल हैं
विशेषज्ञ विकल्प।
-n व्याख्या नाम नाम के बजाय HMM नंबर के रूप में। नंबरिंग 0 से शुरू होती है
उदाहरण के लिए, HMM डेटाबेस से पहला HMM लाने के लिए कहा जाता है फू, तुम करोगे
हम्म2फ़ेच -n 0 फू.
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन hmm2fetch का उपयोग करें
