मकव्यू - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

मकव्यू - माक संरेखण अनुक्रमणिका और दर्शक

SYNOPSIS

माकिन्डेक्स -i|-v|-b [-c in.सीएनएस] in.map [chr[:प्रारंभ[-समाप्त]] [...]]

मकव्यू [-c in.सीएनएस] in.map

वर्णन

मकव्यू प्रोग्राम का एक सेट है जो संरेखण फ़ाइल में तेजी से यादृच्छिक पहुंच प्राप्त करता है
` . द्वारा उत्पन्नMAQ map', और एक अच्छे GUI के साथ संरेखण प्रदर्शित करता है (ग्राफिकल उपयोगकर्ता
इंटरफेस)। यह गति, मेमोरी और डिस्क उपयोग में अत्यधिक कुशल है। मकव्यू पर आधारित है
ओपनजीएल और मैक ओएस एक्स और लिनक्स दोनों पर काम करने के लिए जाना जाता है। विंडोज़ में पोर्ट करना सिद्धांत रूप में है
आसान।

माकिन्डेक्स
माकिन्डेक्स -i|-v|-b [-c in.सीएनएस] in.map [chr[:प्रारंभ[-समाप्त]] [...]]

-i संरेखण फ़ाइल को अनुक्रमित करें

-v निर्दिष्ट क्षेत्र में संरेखण को `maq mapview' प्रारूप में प्रिंट करें

-b निर्दिष्ट क्षेत्र में संरेखण को बाइनरी .map प्रारूप में डंप करें

-c फ़ाइल एक ही समय में maqview में देखने के लिए Maq सर्वसम्मति फ़ाइल को अनुक्रमित करें

कार्यक्रम माकिन्डेक्स एक एमएक्यू संरेखण फ़ाइल को अनुक्रमित करता है in.map या जल्दी से सभी पठन को पुनः प्राप्त करता है
एक या कई क्षेत्र। में से एक -i, -v और -b उपयोग किया जाना चाहिए। के लिये -v or -b, कम से कम एक
`chrX', `chrX:1000' या `chrX:1,000-2,000' जैसे क्षेत्र निर्दिष्ट किए जाने चाहिए। एकाधिक क्षेत्र
अनुमति हैं।

मकव्यू
मकव्यू [-c in.सीएनएस] in.map

-c फ़ाइल माक सर्वसम्मति फ़ाइल

कार्यक्रम मकव्यू ग्राफिकल विंडो में पठन संरेखण प्रदर्शित करता है। कब in.सीएनएस is
निर्दिष्ट, शीर्ष अनुक्रम संदर्भ है, इसके बाद माक सर्वसम्मति अनुक्रम है;
अन्यथा, बहुमत-शासन की सहमति की गणना की जाएगी।

मैकव्यू के दो दृश्य हैं: अनुक्रम दृश्य और बॉक्स दृश्य। अनुक्रम दृश्य में, अनुक्रम पढ़ें
स्क्रीन पर प्रिंट हो जाएगा। गहरा आधार निम्न आधार गुणों और लाल वाले को दर्शाता है
संदर्भ की तुलना में अंतर दिखाएं यदि in.सीएनएस निर्दिष्ट है या करने के लिए
बहुमत-शासन की सहमति नहीं तो। बॉक्स व्यू में, विभिन्न प्रकार के न्यूक्लियोटाइड हैं
ए के लिए हरे, सी के लिए सियान, जी के लिए नारंगी, टी के लिए लाल और अंधेरे के साथ रंगीन बक्से के रूप में दर्शाया गया है
एन के लिए ग्रे। रंगों की संतृप्ति आधार गुणों और मोटाई की रेखाओं को इंगित करती है
रीड्स रीड एलाइनमेंट के मैपिंग गुणों को दर्शाता है। ज़ूम इन/आउट केवल समर्थित है
बॉक्स दृश्य में। दोनों दृश्यों में, विंडो के नीचे स्थित स्टेटस बार कुछ दिखाएगा
कुंजी स्पर्श के बारे में जानकारी, और माउस द्वारा इंगित नाम और आधार गुण पढ़ें।

संरेखण को नेविगेट करना विभिन्न कुंजी बाइंडिंग द्वारा पूरा किया जाता है।

· कुंजी बाइंडिंग:

? प्रदर्शन सहायता
बाहर जाएं
अनुक्रम दृश्य
बॉक्स दृश्य
पी पिछले संदर्भ अनुक्रम पर स्विच करें
n अगले संदर्भ अनुक्रम पर स्विच करें
आर ताज़ा करें

द्वारा बताई गई स्थिति पर जाएँ
एच / एक आधार से बायीं ओर खिसकें
मैं / एक आधार से दाएँ खिसकें
क / एक पंक्ति से ऊपर जाएँ
जे / एक पंक्ति से नीचे जाएँ
> अगले पढ़ने के लिए ले जाएँ
<पिछले पढ़ने के लिए ले जाएँ
जी / वर्तमान संदर्भ की शुरुआत में ले जाएँ
जी / वर्तमान संदर्भ के अंत में जाएँ
आप / एक पेज से बायीं ओर खिसकें
/ एक पेज से दाएं खिसकें
100 आधारों से आगे बढ़ें
1000 ठिकानों से आगे बढ़ें

+ एक नया दृश्य जोड़ें
- वर्तमान दृश्य हटाएं

दाएं ऑटो-स्क्रॉलिंग को चालू/बंद टॉगल करें
^b बाएं ऑटो-स्क्रॉलिंग को चालू/बंद टॉगल करें
+ ज़ूम इन
- ज़ूम आउट
0 डिफ़ॉल्ट पैमाने पर ज़ूम करें
q मैपिंग गुण दिखाएं/छिपाएं टॉगल करें
e टॉगल डिस्प्ले SE/PE मैपिंग गुण
o एक नई संरेखण फ़ाइल खोलें

एक पूर्णांक दर्ज करें और फिर दबाएं आवश्यक स्थिति में कूदने के लिए।

· एक पूर्णांक दर्ज करें और फिर . के अलावा कोई अन्य कुंजी दबाएं स्क्रॉलिंग में तेजी लाने के लिए
निर्दिष्ट कारक।

· अनुक्रम के साथ आगे बढ़ने के लिए बायाँ-क्लिक करें और पीले क्रॉस को वर्ग में खींचें। सही
किसी कॉलम को हाइलाइट करने के लिए संदर्भ पर क्लिक करें।

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