рдпрд╣ рдХрдорд╛рдВрдб masai_output_pe рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдХрдИ рдореБрдлреНрдд рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдЬреИрд╕реЗ рдХрд┐ рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдореЗрдВ рд╕реЗ рдПрдХ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред
рдХрд╛рд░реНрдпрдХреНрд░рдо:
рдирд╛рдо
masai_output_pe - рдорд╕рд╛рдИ рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ - рдпреБрдЧреНрдорд┐рдд рдЕрдВрдд рдореЛрдб
SYNOPSIS
рдорд╕рд╛рдИ_рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ_рдкреЗ [рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк]
рд╡рд░реНрдгрди
рдорд╕рд╛рдИ рдЕрдиреБрдорд╛рдирд┐рдд рдмреАрдЬреЛрдВ рдФрд░ рдЧреБрдгрдХреЛрдВ рдХреЗ рдЖрдзрд╛рд░ рдкрд░ рдПрдХ рддреЗрдЬрд╝ рдФрд░ рд╕рдЯреАрдХ рд░реАрдб рдореИрдкрд░ рд╣реИ
рдкреАрдЫреЗ рд╣рдЯрдирд╛ред
рджреЗрдЦ http://www.seqan.de/projects/masai рджреЗрдЦреЗрдВред
(рд╕реА) рдПрдирд░рд┐рдХреЛ рд╕рд┐рд░рд╛рдЧреБрд╕рд╛ рджреНрд╡рд╛рд░рд╛ рдХреЙрдкреАрд░рд╛рдЗрдЯ 2011-2012ред
-h, --рдорджрдж
рдпрд╣ рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛ рд╕рдВрджреЗрд╢ рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рд┐рдд рдХрд░рддрд╛ рд╣реИред
--рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг
рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг рдЬрд╛рдирдХрд╛рд░реА рдкреНрд░рджрд░реНрд╢рд┐рдд рдХрд░реЗрдВ
рдЬреЛрдбрд╝реА рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк:
-рдПрдирдЬреАрдУ, --рдиреЛ-рдЧреИрдкреНрд╕
рд░реАрдбреНрд╕ рдХреЛ рдЧреИрдк рдХреЗ рд╕рд╛рде рд╕рдВрд░реЗрдЦрд┐рдд рди рдХрд░реЗрдВред
-NS, --рд▓рд╛рдЗрдмреНрд░реЗрд░реА-рд▓рдВрдмрд╛рдИ NUM
рдкреБрд╕реНрддрдХрд╛рд▓рдп рдХреА рд▓рдВрдмрд╛рдИред рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 220.
-рдЗрд╕, --рд▓рд╛рдЗрдмреНрд░реЗрд░реА-рддреНрд░реБрдЯрд┐ NUM
рдкреБрд╕реНрддрдХрд╛рд▓рдп рдХреА рд▓рдВрдмрд╛рдИ рд╕рд╣рд┐рд╖реНрдгреБрддрд╛ред рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: 50.
рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк:
-t, --tmp-рдлрд╝реЛрд▓реНрдбрд░ рдПрд╕рдЯреАрдЖрд░
рдПрдХ рд╡рд┐рд╢рд╛рд▓ рдЕрд╕реНрдерд╛рдпреА рдлрд╝реЛрд▓реНрдбрд░ рдирд┐рд░реНрджрд┐рд╖реНрдЯ рдХрд░реЗрдВред рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдЬреАрдиреЛрдо рдлрд╝реЛрд▓реНрдбрд░ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВред
-o, --рдирд┐рд░реНрдЧрдо рд╕рдВрдЪрд┐рдХрд╛ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓
рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд┐рд░реНрджрд┐рд╖реНрдЯ рдХрд░реЗрдВред рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ: рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо рдЙрдкрд╕рд░реНрдЧ рдкрдврд╝рддрд╛ рд╣реИ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВред рдорд╛рдиреНрдп рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдкреНрд░рдХрд╛рд░
рд╣реИрдВ: рд░реЙ рдФрд░ рд╕реИрдоред
-рдПрди рд╕реА, --рдХреЛрдИ рд╕рд┐рдЧрд╛рд░ рдирд╣реАрдВ
рд╕рд┐рдЧрд╛рд░ рд╕реНрдЯреНрд░рд┐рдВрдЧ рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рди рдХрд░реЗрдВред рдпрд╣ рдХреЗрд╡рд▓ SAM рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдХреЛ рдкреНрд░рднрд╛рд╡рд┐рдд рдХрд░рддрд╛ рд╣реИред
рдбреАрдмрдЧ рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк:
-рд░рд╛, --рдиреЛ-рдбрдВрдк
рдкрд░рд┐рдгрд╛рдо рдордд рдлреЗрдВрдХреЛред
VERSION
masai_output_pe рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг: 0.7.1 [14053] рдЕрдВрддрд┐рдо рдЕрджреНрдпрддрди 2013-05-16
onworks.net рд╕реЗрд╡рд╛рдУрдВ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди masai_output_pe рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ