यह कमांड प्राइमर है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
प्राइमर - पीसीआर प्राइमर चुनने के लिए प्राइमर3 का सरल संस्करण
SYNOPSIS
प्राइमरों -अनुक्रम Seqall [-लक्षित क्षेत्र रेंज] [-मिनसाइज पूर्णांक] [-अधिकतम आकार पूर्णांक]
[-maxdifftm नाव] [-स्पष्ट करेंध्वज बूलियन] [-संख्या वापसी पूर्णांक] -आउटफाइल आउटफाइल
प्राइमरों -मदद
वर्णन
प्राइमरों EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "न्यूक्लिक: प्राइमर" कमांड समूह (समूहों) का हिस्सा है।
विकल्प
निवेश अनुभाग
-अनुक्रम Seqall
प्राइमर चुनने का क्रम। अनुक्रम 5' -> 3' प्रस्तुत किया जाना चाहिए
अतिरिक्त अनुभाग
-लक्षित क्षेत्र रेंज
यदि एक या अधिक लक्ष्य निर्दिष्ट किए गए हैं तो एक कानूनी प्राइमर जोड़ी को कम से कम एक को फ़्लैंक करना चाहिए
उनमें से। एक लक्ष्य एक साधारण अनुक्रम दोहराने वाली साइट हो सकती है (उदाहरण के लिए एक सीए रिपीट) या
एकल-आधार-जोड़ी बहुरूपता। मान की स्पेस से अलग की गई सूची होनी चाहिए
, जोड़े कहाँ किसी लक्ष्य के पहले आधार का सूचकांक है, और
अंतिम उदाहरण 50,51 में 2 स्थिति पर 50 आधारों को घेरने के लिए प्राइमरों की आवश्यकता होती है
और 51।
-मिनसाइज पूर्णांक
प्राइमर की न्यूनतम स्वीकार्य लंबाई। 0 से बड़ा और कम या बराबर होना चाहिए
MAX-SIZE तक। डिफ़ॉल्ट मान: 18
-अधिकतम आकार पूर्णांक
एक प्राइमर की अधिकतम स्वीकार्य लंबाई (आधार में)। वर्तमान में यह पैरामीटर नहीं हो सकता
35 से बड़ा। यह सीमा प्राइमर3 के अधिकतम ओलिगो आकार द्वारा नियंत्रित होती है
पिघलने-तापमान मान्य है। डिफ़ॉल्ट मान: 27
-maxdifftm नाव
के पिघलने के तापमान के बीच अधिकतम स्वीकार्य (अहस्ताक्षरित) अंतर
आगे और पीछे प्राइमर। डिफ़ॉल्ट मान: 100.0
उत्पादन अनुभाग
-स्पष्ट करेंध्वज बूलियन
यदि यह ध्वज गैर-0 है, तो बाएँ-व्याख्या और दाएँ-व्याख्या, आउटपुट उत्पन्न करें, जो हैं
प्राइमर3 द्वारा जांचे गए प्राइमर जोड़ियों की संख्या के बारे में जानकारी प्रदान करने का इरादा है,
और विभिन्न कारणों से छोड़ी गई संख्या के आँकड़े। डिफ़ॉल्ट मान: एन
-संख्या वापसी पूर्णांक
लौटने के लिए प्राइमर जोड़े की अधिकतम संख्या। लौटाए गए प्राइमर जोड़े को क्रमबद्ध किया जाता है
उनकी 'गुणवत्ता', दूसरे शब्दों में उद्देश्य फ़ंक्शन के मूल्य से (जहां एक कम
संख्या एक बेहतर प्राइमर जोड़ी को इंगित करती है)। सावधानी: इस पैरामीटर को बड़े पैमाने पर सेट करना
मूल्य चलने का समय बढ़ाएगा। डिफ़ॉल्ट मान: 5
-आउटफाइल आउटफाइल
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन प्राइमर्स का उपयोग करें
