यह कमांड TransDecoder.LongOrfs है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
ट्रांसडिकोडर.लॉन्गऑर्फ्स - ट्रांस्क्रिप्टोम प्रोटीन भविष्यवाणी
उपयोग
आवश्यक:
-टी प्रतिलेख.fasta
वैकल्पिक:
-एम न्यूनतम प्रोटीन लंबाई (डिफ़ॉल्ट: 100)
-जी आनुवंशिक कोड (डिफ़ॉल्ट: सार्वभौमिक; पर्लडॉक देखें; विकल्प: यूप्लोट्स, टेट्राहिमेना, कैंडिडा, एसिटाबुलरिया)
-एस स्ट्रैंड-विशिष्ट (केवल शीर्ष स्ट्रैंड का विश्लेषण करता है)
जेनेटिक संहिताओं
देखोhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. ये वर्तमान में समर्थित हैं:
सार्वभौमिक (डिफ़ॉल्ट)
यूप्लॉट्स
Tetrahymena
कैंडिडा
Acetabularia
माइटोकॉन्ड्रियल-कैनोनिकल
माइटोकॉन्ड्रियल-कशेरुकी
माइटोकॉन्ड्रियल-आर्थ्रोपोड्स
माइटोकॉन्ड्रियल-इचिनोडर्म्स
माइटोकॉन्ड्रियल-मोलस्क
माइटोकॉन्ड्रियल-एसिडियन्स
माइटोकॉन्ड्रियल-नेमाटोड
माइटोकॉन्ड्रियल-प्लैटिहेल्मिन्थ्स
माइटोकॉन्ड्रियल-खमीर
माइटोकॉन्ड्रियल-यूएस्कोमाइसेट्स
माइटोकॉन्ड्रियल-प्रोटोज़ोअन
2015-12-28 ट्रांसडिकोडर.लोंगोर्फ्स(1)
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन TransDecoder.LongOrfs का उपयोग करें