рдпрд╣ miRge3 рдирд╛рдо рдХрд╛ Linux рдРрдк рд╣реИ рдЬрд┐рд╕рдХреА рдирд╡реАрдирддрдо рд░рд┐рд▓реАрдЬрд╝ рдХреЛ unmapped_tmp.zip рдХреЗ рд░реВрдк рдореЗрдВ рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред рдЗрд╕реЗ рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдореБрдлреНрдд рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдореЗрдВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред
miRge3 рдирд╛рдо рдХреЗ рдЗрд╕ рдРрдк рдХреЛ OnWorks рдХреЗ рд╕рд╛рде рдореБрдлреНрдд рдореЗрдВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдЪрд▓рд╛рдПрдВред
рдЗрд╕ рдРрдк рдХреЛ рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЗрди рдирд┐рд░реНрджреЗрд╢реЛрдВ рдХрд╛ рдкрд╛рд▓рди рдХрд░реЗрдВ:
- 1. рдЗрд╕ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдХреЛ рдЕрдкрдиреЗ рдкреАрд╕реА рдореЗрдВ рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВред
- 2. рд╣рдорд╛рд░реЗ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдкреНрд░рдмрдВрдзрдХ рдореЗрдВ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX рдЙрд╕ рдЙрдкрдпреЛрдЧрдХрд░реНрддрд╛ рдирд╛рдо рдХреЗ рд╕рд╛рде рджрд░реНрдЬ рдХрд░реЗрдВ рдЬреЛ рдЖрдк рдЪрд╛рд╣рддреЗ рд╣реИрдВред
- 3. рдЗрд╕ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдХреЛ рдРрд╕реЗ рдлрд╛рдЗрд▓ рдореИрдиреЗрдЬрд░ рдореЗрдВ рдЕрдкрд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВред
- 4. рдЗрд╕ рд╡реЗрдмрд╕рд╛рдЗрдЯ рд╕реЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдпрд╛ рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХреЛрдЬрд╝ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рд╢реБрд░реВ рдХрд░реЗрдВред
- 5. рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдУрдПрд╕ рд╕реЗ рдЖрдкрдиреЗ рдЕрднреА рд╢реБрд░реБрдЖрдд рдХреА рд╣реИ, рд╣рдорд╛рд░реЗ рдлрд╛рдЗрд▓ рдореИрдиреЗрдЬрд░ рдХреЛ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX рдЙрд╕ рдпреВрдЬрд░рдиреЗрдо рдХреЗ рд╕рд╛рде рдЬрд╛рдПрдВ рдЬреЛ рдЖрдк рдЪрд╛рд╣рддреЗ рд╣реИрдВред
- 6. рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ, рдЗрд╕реЗ рдЗрдВрд╕реНрдЯреЙрд▓ рдХрд░реЗрдВ рдФрд░ рдЗрд╕реЗ рдЪрд▓рд╛рдПрдВред
miRge3
Ad
рд╡рд░реНрдгрди
рдЫреЛрдЯреЗ рдЖрд░рдПрдирдП рдЕрдиреБрдХреНрд░рдордг рдбреЗрдЯрд╛ рдХрд╛ рд╡реНрдпрд╛рдкрдХ рд╡рд┐рд╢реНрд▓реЗрд╖рдг рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдкрд╛рдпрдерди рдкреИрдХреЗрдЬ рдХрд╛ рдПрдХ рдЕрджреНрдпрддрди, рдЬрд┐рд╕рдореЗрдВ miRNA рдПрдиреЛрдЯреЗрд╢рди, A-рдЯреВ-I рд╕рдВрдкрд╛рджрди, рдирд╡реАрди miRNA рдкрд╣рдЪрд╛рди, рдЖрдЗрд╕реЛрдореАрдЖрд░ рд╡рд┐рд╢реНрд▓реЗрд╖рдг, IGV рдХреЗ рдорд╛рдзреНрдпрдо рд╕реЗ рд╡рд┐рдЬрд╝реБрдЕрд▓рд╛рдЗрдЬрд╝реЗрд╢рди, рдЕрджреНрд╡рд┐рддреАрдп рдЖрдгрд╡рд┐рдХ рдкрд╣рдЪрд╛рдирдХрд░реНрддрд╛рдУрдВ (UMI) рдХреЛ рд╕рдВрд╕рд╛рдзрд┐рдд рдХрд░рдирд╛, tRF рдкрд╣рдЪрд╛рди рдФрд░ рдЗрдВрдЯрд░реИрдХреНрдЯрд┐рд╡ рдЙрддреНрдкрд╛рджрди рд╢рд╛рдорд┐рд▓ рд╣реИред рдЧреНрд░рд╛рдлрд╝рд┐рдХрд▓ рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ.
miRge3.0 рдХреЛ Python v3.8 рдореЗрдВ рд╡рд┐рдХрд╕рд┐рдд рдХрд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛ рд╣реИ рдФрд░ рдпрд╣ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдкрд┐рдЫрд▓реЗ рд╕рдВрд╕реНрдХрд░рдг miRge2.0 рдХрд╛ рд╣рд╛рд▓рд┐рдпрд╛ рдЕрдкрдбреЗрдЯ рд╣реИред рдЗрд╕ рдмрд┐рд▓реНрдб рдореЗрдВ рдХрдорд╛рдВрдб рд▓рд╛рдЗрди рдЗрдВрдЯрд░рдлреЗрд╕ (рд╕реАрдПрд▓рдЖрдИ) рдФрд░ рдХреНрд░реЙрд╕-рдкреНрд▓реЗрдЯрдлреЙрд░реНрдо рдЧреНрд░рд╛рдлрд┐рдХрд▓ рдпреВрдЬрд░ рдЗрдВрдЯрд░рдлреЗрд╕ (рдЬреАрдпреВрдЖрдИ) рд╢рд╛рдорд┐рд▓ рд╣реИрдВред рдЕрдзрд┐рдХ рдЬрд╛рдирдХрд╛рд░реА рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдиреАрдЪреЗ рджрд┐рдП рдЧрдП рджрд╕реНрддрд╛рд╡реЗрдЬрд╝реАрдХрд░рдг рд▓рд┐рдВрдХ рджреЗрдЦреЗрдВред
рджрд░реНрд╢рдХ
рдЧреИрд░-рд▓рд╛рднрдХрд╛рд░реА рд╕рдВрдЧрдарди, рд╕реВрдЪрдирд╛ рдкреНрд░реМрджреНрдпреЛрдЧрд┐рдХреА, рд╕реНрд╡рд╛рд╕реНрдереНрдп рд╕реЗрд╡рд╛ рдЙрджреНрдпреЛрдЧ, рд╡рд┐рдЬреНрдЮрд╛рди/рдЕрдиреБрд╕рдВрдзрд╛рди, рдбреЗрд╡рд▓рдкрд░реНрд╕, рдЕрдВрддрд┐рдо рдЙрдкрдпреЛрдЧрдХрд░реНрддрд╛/рдбреЗрд╕реНрдХрдЯреЙрдк
рдпреВрдЬрд░ рдЗрдВрдЯрд░рдлреЗрд╕
рдЗрд▓реЗрдХреНрдЯреНрд░рд╛рди
рдкреНрд░реЛрдЧреНрд░рд╛рдорд┐рдВрдЧ рднрд╛рд╖рд╛
рдкрд╛рдпрдерди, рдЬрд╛рд╡рд╛рд╕реНрдХреНрд░рд┐рдкреНрдЯ
рд╢реНрд░реЗрдгрд┐рдпрд╛рдБ
рдпрд╣ рдПрдХ рдПрдкреНрд▓рд┐рдХреЗрд╢рди рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ https://sourceforge.net/projects/mirge3/ рд╕реЗ рднреА рдкреНрд░рд╛рдкреНрдд рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред рд╣рдорд╛рд░реЗ рдирд┐рдГрд╢реБрд▓реНрдХ рдСрдкрд░реЗрдЯрд┐рд╡ рд╕рд┐рд╕реНрдЯрдореЛрдВ рдореЗрдВ рд╕реЗ рдПрдХ рд╕реЗ рд╕рдмрд╕реЗ рдЖрд╕рд╛рди рддрд░реАрдХреЗ рд╕реЗ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЪрд▓рд╛рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЗрд╕реЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдореЗрдВ рд╣реЛрд╕реНрдЯ рдХрд┐рдпрд╛ рдЧрдпрд╛ рд╣реИред