altree-convertp - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

altree-convert - Judul...

RINGKASAN

altree-convert [opsi]

Pilihan:
--versi versi program
--short-help|h pesan bantuan singkat
--bantuan pesan bantuan dengan deskripsi opsi
--man dokumentasi lengkap
--file-input-pertama|saya memasukkan file 1
--second-input-file|j input file 2 (tidak wajib)
--output-file|o file output
--case-control-output|c output yang berisi nb kasus/kontrol
--tipe data|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHILIP
--reconstruct-prog|r FASE|FAMHAP
--data-quali|q Jenis data: kualitatif atau kuantitatif
--nbind-threshold|s Jumlah minimum individu yang diperoleh untuk menyimpan haplotype

PILIHAN

--Versi: kapan
Cetak versi program dan keluar.

--singkat-bantuan
Cetak pesan bantuan singkat dan keluar.

--membantu Cetak pesan bantuan dengan deskripsi opsi dan keluar.

--pria Mencetak halaman manual dan keluar.

--file-input-pertama|i
File input 1 (output dari program rekonstruksi haplotype)

--file masukan kedua|j
Input file 2 (output kedua dari famhap atau file yang berisi status penyakit)

--file-keluaran|o
Berkas keluaran

--keluaran-kontrol-kasus|c
File keluaran yang berisi jumlah kasus dan kontrol yang membawa setiap haplotype

--tipe data|t "DNA"|"SNP"
Jenis data: DNA (ATGCU) atau SNP (0-1)

--filo-prog|p "phylip"|"paap"
Program rekonstruksi filogeni

program-rekonstruksi|r "famhap|fase"
Program rekonstruksi haplotipe

kualitas data|q "kualitatif|kuantitatif"
Jenis data yang dianalisis

nbind-ambang|s
Jumlah minimal individu yang membawa haplotipe diperlukan untuk menyimpannya selama
analisis lebih lanjut. Jika Anda ingin menyimpan semua haplotipe, Anda harus memengaruhi 0 untuk ini
variabel

DESKRIPSI

Kredensial mikro program akan membaca file input yang diberikan dan menghasilkan file input untuk
perangkat lunak rekonstruksi filogenetik paup atau phylip/paml

Gunakan altree-convertp online menggunakan layanan onworks.net