Ini adalah perintah asn2ff yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
asn2ff - mengonversi data biologis ASN.1 ke format datar (versi lama)
RINGKASAN
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a nama file] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l nama file] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o nama file] [-p F] [-q] [-r nama file] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
DESKRIPSI
asn2ff mengubah deskripsi urutan biologis dari format ASN.1 NCBI menjadi salah satu dari
beberapa format file datar. Program ini dibangun di sekitar antarmuka usang; silakan
menggunakan asn2gb(1) sebagai gantinya.
PILIHAN
Ringkasan opsi disertakan di bawah ini.
- Cetak pesan penggunaan
-A X Tampilkan wilayah mulai dari X (defaultnya adalah 0)
-B X Tampilkan wilayah yang berakhir pada X (default adalah posisi terakhir)
-C Tampilkan komentar Bankit
-G Output adalah satu bioseq teratas hanya dalam tampilan genom
-L F Gunakan format baris LOCUS lama (pra-Genbank 127.0)
-M Outputnya hanya peta bioseqs
-R Untuk Rilis GenBank
-V F Jangan gunakan VERSI
-a nama file
Nama file untuk input ASN.1 (default adalah stdin)
-b Masukkan asnfile dalam mode biner
-d Gunakan pengindeksan SeqMgr
-e Input adalah entri Seq
-f b/p/e/s/x/z
Format output:
b GenBank (bawaan)
p GenPept
e EMBL
s PseudoEMBL
x GenBankPilih
z EMBLPEPT
-g Tampilkan nomor gi
-h F Sembunyikan urutan
-k F Jangan gunakan set kompleks (phy-set, mut-set, pop-set)
-l nama file
Log kesalahan ke nama file
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Modus keluaran:
r rilis (default)
d membuang
s payet
c. Kromoskop
k dir-sub-debug
aku dir-sub
e merevisi
p laporan sebagian
-n F Pengikatan gen yang ketat
-o nama file
Nama File Keluaran (defaultnya adalah stdout)
-p F Hilangkan fitur gen baru
-q Outputnya hanya satu bioseq teratas
-r nama file
File log kesalahan keluaran (defaultnya adalah stderr)
-s Input adalah pengiriman Seq
-t Tampilkan teks pesan verbose
-v F Menekan pesan kesalahan
-w Gunakan format keluaran HTML
-y Cetak format bantuan saja
-z Algoritma baru untuk nama organisasi
Gunakan asn2ff online menggunakan layanan onworks.net