Ini adalah perintah bp_bioflat_indexp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bp_bioflat_index.pl - mengindeks file urutan menggunakan Bio::DB::Flat
DESKRIPSI
Buat atau perbarui database urutan biologis yang diindeks dengan
Bio::DB::Skema pengindeksan datar. Argumennya adalah daftar file datar
berisi informasi urutan yang akan diindeks.
PENGGUNAAN
bp_bioflat_index.pl berkas1 berkas2 berkas3...
Pilihan:
--create Membuat atau menginisialisasi ulang indeks. Jika tidak ditentukan,
indeks harus sudah ada.
--format Format file urutan. Harus satu
dari "genbank", "swissprot", "embl" atau "fasta".
--lokasi Jalur ke direktori tempat file indeks
disimpan.
--dbname Nama simbolis dari database yang akan dibuat.
--tipe indeks Jenis indeks yang akan dibuat. Entah "bdb" atau "datar".
"binarysearch" sama dengan "flat".
Opsi dapat disingkat. Misalnya, gunakan -i untuk --indextype.
Variabel lingkungan berikut akan digunakan sebagai default jika opsi yang sesuai
tidak disediakan:
OBDA_FORMAT format file urutan
OBDA_LOCATION jalur ke direktori tempat file indeks disimpan
OBDA_DBNAME nama database
Jenis indeks OBDA_INDEX yang akan dibuat
Gunakan bp_bioflat_indexp online menggunakan layanan onworks.net
