cmtk-jidb - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

jidb - Perbaiki gerakan interleaved menggunakan deblurring berulang bersama

RINGKASAN

jidb [opsi] inImage outImage

DESKRIPSI

Alat ini membagi gambar input yang disisipkan ke dalam gambar pass, mendaftarkannya bersama, dan
merekonstruksi gambar yang dikoreksi gerakan

PILIHAN

Aksi Toolkit Opsi (ini adalah berbagi by semua CMTK peralatan)
--membantu
Tulis daftar opsi baris perintah dasar ke output standar.

--tolong-semua
Tulis daftar lengkap opsi baris perintah dasar dan lanjutan ke output standar.

--wiki
Tulis daftar opsi baris perintah ke keluaran standar di markup MediaWiki.

--pria
Tulis sumber halaman manual dalam markup 'nroff' ke keluaran standar.

--Versi: kapan
Tulis versi toolkit ke output standar.

--gema
Tulis baris perintah saat ini ke output standar.

--tingkat verbose
Tetapkan tingkat verbositas.

--bertele-tele, -v
Tingkatkan verbositas sebesar 1 (tidak digunakan lagi; didukung untuk kompatibilitas mundur).

--utas
Tetapkan jumlah maksimum utas paralel (untuk utas POSIX dan OpenMP).

Interleaving Opsi
--interleave-sumbu
Tentukan sumbu interleave: ini adalah arah akuisisi melalui irisan.
Nilai yang didukung: "tebak-dari-input", "aksial", "sagital", "koronal", "interleave-x",
"interleave-y", "interleave-z", di mana defaultnya adalah "tebak-dari-input", atau gunakan salah satu
sebagai berikut:

--tebak-dari-masukan
Tebak dari gambar masukan [Ini is itu bawaan]

--aksial, -a
Gambar aksial yang disisipkan

--sagital, -s
Gambar sagital yang disisipkan

--mahkota, -c
Gambar koronal yang disisipkan

--interleave-x, -x
Interleaved sepanjang sumbu x

--interleave-y, -y
Disisipkan sepanjang sumbu y

--interleave-z, -z
Interleaved sepanjang sumbu z

--pass , -p
Jumlah umpan yang disisipkan [Bawaan: 2]

--pass-berat , -W
Tetapkan bobot kontribusi untuk operan dalam bentuk 'pass:weight'

Gerakan Koreksi / Pendaftaran Opsi
--referensi-gambar , -R
Gunakan gambar referensi resolusi tinggi terpisah untuk pendaftaran [Bawaan: TIDAK ADA]

--metrik-pendaftaran
Metrik pendaftaran untuk estimasi gerakan dengan registrasi gambar-ke-gambar. Didukung
nilai: "nmi", "mi", "cr", "msd", "cc", di mana defaultnya adalah "msd", atau gunakan salah satu
sebagai berikut:

--nmi
Gunakan Informasi Reksa yang Dinormalisasi untuk pendaftaran pass-to-referensi

--mi Gunakan Informasi Reksa standar untuk pendaftaran pass-to-referensi

--kr Gunakan Rasio Korelasi untuk pendaftaran pass-to-referensi

--msd
Gunakan Perbedaan Rata-Rata Kuadrat untuk pendaftaran pass-to-referensi [Ini is itu
bawaan]

--cc Gunakan Cross-Correlation untuk pendaftaran pass-to-reference

--import-xforms-jalur
Jalur file dari mana untuk mengimpor transformasi antara melewati. [Bawaan: TIDAK ADA]

--ekspor-xforms-path
Jalur file yang akan diekspor transformasi antar lintasan. [Bawaan: TIDAK ADA]

Volume Injeksi Opsi
--injeksi-kernel-sigma , -S
Standar deviasi kernel Gaussian untuk injeksi volume [Bawaan: 1]

--injeksi-kernel-radius , -r
Jari-jari pemotongan kernel injeksi [Bawaan: 4]

mengaburkan Opsi
--psf
Kernel untuk rekonstruksi interpolasi terbalik Nilai yang didukung: "kotak",
"gaussian", atau gunakan salah satu dari berikut ini:

--kotak
PSF berbentuk kotak

--gaussian
PSF berbentuk Gaussian

--psf-skala
Tetapkan faktor skala global untuk ukuran fungsi penyebaran titik, yang dengan sendirinya diturunkan dari
gambar masukan. [Bawaan: 1]

Optimization Opsi
--kesalahan urutan keempat, -f
Gunakan kesalahan urutan keempat (bukan urutan kedua) untuk pengoptimalan.

--num-iterasi , -n
Jumlah maksimum iterasi interpolasi terbalik [Bawaan: 20]

--tidak ada pemotongan, -T
Matikan pemotongan intensitas regional

--l-norma-berat
Tetapkan bobot batasan untuk regularisasi L-Norm tipe Tikhonov (0 menonaktifkan batasan)
[Bawaan: 0]

Keluaran Opsi
--tulis-disuntik-gambar
Tulis gambar injeksi volume awal ke jalur [Bawaan: TIDAK ADA]

--tulis-gambar-sebagai-float, -F
Tulis gambar keluaran sebagai floating point [default: sama dengan input]

PENULIS

Torsten Rohlfing, dengan kontribusi dari Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, dan Yaroslav Halchenko

Gunakan cmtk-jidb online menggunakan layanan onworks.net