Ini adalah perintah fuzznuce yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
fuzznuc - Cari pola dalam urutan nukleotida
RINGKASAN
bulu halus -urutan seqall -pola belt hold -melengkapi boolean -file keluar melaporkan
bulu halus -bantu
DESKRIPSI
bulu halus adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Nucleic:Motifs".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan seqall
-pola belt hold
Kode satu huruf IUPAC standar untuk nukleotida digunakan. Simbol 'n' adalah
digunakan untuk posisi di mana setiap nukleotida diterima. Ambiguitas ditunjukkan oleh
daftar nukleotida yang dapat diterima untuk posisi tertentu, di antara tanda kurung siku '[
]'. Misalnya: [ACG] singkatan dari A atau C atau G. Ambiguitas juga ditunjukkan oleh
daftar di antara sepasang tanda kurung kurawal '{ }' nukleotida yang tidak diterima
pada posisi tertentu. Misalnya: {AG} adalah singkatan dari nukleotida apa pun kecuali A dan G. Masing-masing
elemen dalam suatu pola dipisahkan dari tetangganya dengan tanda '-'. (Opsional di fuzznuc).
Pengulangan elemen pola dapat ditunjukkan dengan mengikuti elemen itu
dengan nilai numerik atau rentang numerik antara tanda kurung. Contoh: N(3)
sesuai dengan NNN, N(2,4) sesuai dengan NN atau NNN atau NNNN. Ketika sebuah pola
terbatas pada ujung 5' atau 3' dari suatu barisan, pola itu dimulai dengan a
Simbol '<' atau masing-masing diakhiri dengan simbol '>'. Sebuah periode mengakhiri pola.
(Opsional di fuzznuc). Misalnya, [CG](5)TG{A}N(1,5)C
Advanced bagian
-melengkapi boolean
Nilai default: N
Keluaran bagian
-file keluar melaporkan
Gunakan fuzznuce online menggunakan layanan onworks.net
