Ini adalah perintah gmx-saxs yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
gmx-saxs - Hitung spektrum hamburan sinar-X sudut kecil
RINGKASAN
saksofon gmx [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr/.gro/...>]] [-n [<.ndx>]]
[-d [<.dat>]] [-persegi [<.xvg>]] [-b ] [-e ]
[-dt ] [-xvg ] [-ng ] [-mulaiq ]
[-akhirq ] [-energi ]
DESKRIPSI
gmx saksofon menghitung faktor struktur SAXS untuk grup indeks yang diberikan berdasarkan Cromer's
metode. File topologi dan lintasan diperlukan.
PILIHAN
Opsi untuk menentukan file input:
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
Lintasan: xtc tr cpt gro g96 pdb tng
-s [<.tpr/.gro/...>] (topol.tpr)
Struktur + massa (db): tpr gro g96 pdb baiklah
-n [<.ndx>] (indeks.ndx) (Opsional)
File indeks
-d [<.dat>] (faktor.dat) (Opsional)
File data umum
Opsi untuk menentukan file keluaran:
-persegi [<.xvg>] (persegi.xvg)
file xvgr/xmgr
Pilihan lainnya:
-b (0)
Bingkai pertama (ps) yang dibaca dari lintasan
-e (0)
Bingkai terakhir (ps) untuk dibaca dari lintasan
-dt (0)
Gunakan frame hanya saat t MOD dt = pertama kali (ps)
-xvg
pemformatan plot xvg: xmgrace, xmgr, tidak ada
-ng (1)
Jumlah grup untuk menghitung SAXS
-mulaiq (0)
Mulai q (1/nm)
-akhirq (60)
Akhir q (1/nm)
-energi (12)
Energi sinar-X yang masuk (keV)
Gunakan gmx-saxs online menggunakan layanan onworks.net
