Ini adalah perintah masai_output_pe yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
masai_output_pe - Output Masai - Mode Akhir Berpasangan
RINGKASAN
masai_output_pe [OPSI]
DESKRIPSI
Masai adalah pembaca peta yang cepat dan akurat berdasarkan perkiraan benih dan banyak
mundur.
Lihat http://www.seqan.de/projects/masai for more information.
(c) Hak Cipta 2011-2012 oleh Enrico Siragusa.
-h, --membantu
Menampilkan pesan bantuan ini.
--Versi: kapan
Menampilkan informasi versi
Opsi Penyandingan:
-ng, --tidak ada celah
Jangan sejajarkan bacaan dengan celah.
-II, --panjang perpustakaan NUM
Panjang perpustakaan. Standar: 220.
-NS, --perpustakaan-kesalahan NUM
Toleransi panjang perpustakaan. Standar: 50.
Opsi Keluaran:
-t, --tmp-folder STR
Tentukan folder sementara yang besar. Default: gunakan folder genom.
-o, --berkas keluaran FILE
Tentukan file keluaran. Default: gunakan awalan nama file reads. Jenis file yang valid
adalah: mentah dan sam.
-nc, --tanpa rokok
Jangan mengeluarkan string CIGAR. Ini hanya mempengaruhi keluaran SAM.
Opsi Debug:
-nd, --tidak-membuang
Jangan membuang hasil.
VERSION
versi masai_output_pe: 0.7.1 [14053] Pembaruan terakhir 2013-05-16
Gunakan masai_output_pe online menggunakan layanan onworks.net
