Ini adalah perintah mia-2dmyocard-ica yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator atau MAC OS online emulator
PROGRAM:
NAMA
mia-2dmyocard-ica - Jalankan analisis ICA pada serangkaian gambar 2D
RINGKASAN
mia-2dmyocard-ica -i [pilihan]
DESKRIPSI
mia-2dmyocard-ica Program ini digunakan untuk menjalankan ICA pada serangkaian perfusi miokard
gambar untuk membuat referensi sintetis yang dapat digunakan untuk koreksi gerakan oleh gambar
Registrasi. Jika tujuannya adalah untuk menjalankan kompensasi gerakan penuh maka lebih baik untuk membuat
satu set segmentasi dan gunakan mia-2dmyoica-nonrigid. Jika data input diberikan dengan cara a
segmentasi set, lalu di juga bisa menggunakan mia-2dmyocard-icaseries. Program ini adalah
pada dasarnya digunakan untuk menguji berbagai opsi tentang cara menjalankan gambar referensi ICA
penciptaan.
PILIHAN
-i --in-base=(masukan, diperlukan); io
masukan nama file ofolloing pattern nameXXXX.ext X=angka Untuk file yang didukung
jenis lihat PLUGIN:2dimage/io
--koef =
koefisien pencampuran keluaran ke file ini
-o --out-base=(keluaran); rangkaian
basis nama file keluaran
-t --tipe=exr
jenis file keluaran
Didukung nilai-nilai adalah:( @, BMP, DCM, EXR, jpeg, JPG, PNG, MENTAH,
TI, BERTENGKAR, V, MELIHAT, bmp, DCM, mantan, jpeg, jpg, png, mentah, tipus,
bertengkar, v, pemandangan, )
-k --lewati=2
lewati gambar di awal seri lewati gambar di awal seri
-e --akhir=60
gambar terakhir dalam seri gambar terakhir dalam seri
-C --komponen=0
tidak komponen, 0=perkiraan secara otomatisnr. komponen, 0=perkiraan
secara otomatis
-m --strip-berarti
hapus gambar rata-rata dari seri
-f --simpan-fitur=
simpan gambar fitur
-p --strip-periodik
hapus hanya komponen periodik
-x --max-ica-iterasi=0
iterasi pemecah ICA maks. iterasi pemecah ICA maks
-n --ica-normalisasi
ica_menormalkan gambar fitur
--semua-fitur=
simpan semua gambar fitur ke
-L --LV-pangkas-amp=0
Amplifikasi crop mask LV, 0.0 = jangan potong LV crop mask amplification, 0.0
= jangan dipotong
-a --komponen otomatis
estimasi otomatis jumlah komponen berdasarkan korelasi. menyiratkan
-m dan -n (Eksperimental)
Bantuan & Info
-V --verbose=peringatan
verbositas output, pesan cetak dari tingkat tertentu dan prioritas yang lebih tinggi.
Prioritas yang didukung mulai dari level terendah adalah:
Info - Pesan tingkat rendah
jejak - Jejak panggilan fungsi
gagal - Laporkan kegagalan pengujian
peringatan - Peringatan
kesalahan - Laporkan kesalahan
men-debug - Keluaran debug
pesan - Pesan biasa
fatal - Laporkan hanya kesalahan fatal
--hak cipta
cetak informasi hak cipta
-h --bantuan
cetak bantuan ini
-? --penggunaan
cetak bantuan singkat
--Versi: kapan
cetak nomor versi dan keluar
Pengolahan
--utas=-1
Jumlah maksimum utas yang digunakan untuk pemrosesan, Jumlah ini harus lebih rendah
atau sama dengan jumlah inti prosesor logis dalam mesin. (-1:
estimasi otomatis). Jumlah utas maksimum yang digunakan untuk pemrosesan, Ini
nomor harus lebih rendah atau sama dengan jumlah inti prosesor logis di
mesin. (-1: estimasi otomatis).
PLUGIN: 2 gambar/io
bmp Dukungan input/output gambar 2D BMP
Ekstensi file yang dikenali: .BMP, .bmp
Jenis elemen yang didukung:
data biner, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit
kumpulan data IO virtual ke dan dari kumpulan data internal
Ekstensi file yang dikenali: .@
dikom Gambar 2D io untuk DICOM
Ekstensi file yang dikenali: .DCM, .dcm
Jenis elemen yang didukung:
bertanda 16 bit, tidak bertanda 16 bit
exr plugin io 2dimage untuk gambar OpenEXR
Ekstensi file yang dikenali: .EXR, .exr
Jenis elemen yang didukung:
tidak ditandatangani 32 bit, titik mengambang 32 bit
jpg plugin io 2dimage untuk gambar skala abu-abu jpeg
Ekstensi file yang dikenali: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg
Jenis elemen yang didukung:
8 bit yang tidak ditandatangani
png plugin io 2dimage untuk gambar png
Ekstensi file yang dikenali: .PNG, .png
Jenis elemen yang didukung:
data biner, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit
mentah Dukungan output gambar 2D RAW
Ekstensi file yang dikenali: .RAW, .raw
Jenis elemen yang didukung:
data biner, bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda,
ditandatangani 32 bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64
sedikit
tif Dukungan input/output gambar 2D TIFF
Ekstensi file yang dikenali: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff
Jenis elemen yang didukung:
data biner, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit
pemandangan plugin io 2dimage untuk gambar vista
Ekstensi file yang dikenali: .V, .VISTA, .v, .vista
Jenis elemen yang didukung:
data biner, bertanda 8 bit, 8 bit tidak bertanda, 16 bit bertanda, 16 bit tidak bertanda,
ditandatangani 32 bit, 32 bit tidak ditandatangani, titik mengambang 32 bit, titik mengambang 64
sedikit
CONTOH
Evaluasi referensi sintetis dari gambar imageXXXX.exr dan simpan ke refXXXX.exr
dengan menggunakan lima komponen independen, mean stripping, normalizing, dan skipping 2 gambar.
mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n
PENULIS
Gert Wolny
HAK CIPTA
Perangkat lunak ini adalah Hak Cipta (c) 1999-2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Spanyol. Itu datang
dengan BENAR-BENAR TANPA JAMINAN dan Anda dapat mendistribusikannya kembali di bawah ketentuan GNU
LISENSI UMUM UMUM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk informasi lebih lanjut, jalankan program dengan
opsi '--hak cipta'.
Gunakan mia-2dmyocard-ica online menggunakan layanan onworks.net