Ini adalah perintah obgrep yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
obgrep — program pencarian molekuler lanjutan menggunakan SMARTS
RINGKASAN
obgrep [PILIHAN] 'Pola SMART' nama file
DESKRIPSI
Alat obgrep dapat digunakan untuk mencari molekul di dalam file database multi-molekul
(misalnya, SMILES, SDF, dll.) atau di beberapa file.
PILIHAN
Jika hanya nama file yang diberikan, obgrep akan mencoba menebak jenis file dari nama file
perpanjangan.
-c Cetak jumlah kecocokan
-f Kecocokan penuh, cetak molekul pencocokan hanya ketika jumlah atom berat juga sama
dengan jumlah atom dalam pola SMARTS
-i format
Menentukan format input dan output, lihat babel(1) untuk format yang tersedia
-n Hanya cetak nama molekulnya
-t # Cetak molekul hanya jika pola muncul # kali di dalam molekul
-v Balikkan yang cocok, cetak molekul yang tidak cocok
CONTOH
Perhatikan bahwa dalam semua contoh, pola SMARTS diapit oleh tanda kutip tunggal '...' untuk memastikan
itu tidak diubah oleh shell.
Cetak semua molekul dengan gugus metilamin:
obgrep 'CN' database.smi
Cetak semua molekul tanpa gugus metilamin:
obgrep -v 'CN' database.smi
Cetak jumlah molekul tanpa gugus metilamin:
obgrep -v -c 'CN' database.smi
Cetak methylamine (jika ada di file):
obgrep -f 'CN' database.smi
Cetak metilamin dan/atau metanol (jika ada):
obgrep -f 'C[N,O]' database.smi
Cetak semua molekul dengan karbon aromatik di semua file SMILES di direktori (yaitu, *.smi)
obgrep 'c' *.smi
Gunakan obgrep online menggunakan layanan onworks.net
