Ini adalah aplikasi Linux bernama kallisto yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai kallisto_windows-v0.50.0.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama kallisto dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
kalisto
DESKRIPSI
kallisto adalah program untuk kuantifikasi kelimpahan transkrip yang mendekati optimal dari data RNA-Seq, atau lebih umum dari sekuens target menggunakan pembacaan sekuensing throughput tinggi. Ini didasarkan pada gagasan menggunakan pseudoalignment untuk dengan cepat menentukan pembacaan dan kompatibilitas target, tanpa perlu penyelarasan.
Menurut tolok ukur yang dilakukan pada komputer desktop Mac, kallisto dapat mengukur 30 juta pembacaan RNA-seq massal manusia dalam waktu kurang dari 3 menit hanya dengan urutan pembacaan dan indeks transkriptom, yang dengan sendirinya dapat memakan waktu lebih dari 10 menit untuk dibuat. Dan karena menggunakan pseudoalignment, ini tahan terhadap kesalahan dalam pembacaan dan mempertahankan informasi kunci yang diperlukan untuk kuantifikasi. Hal ini membuat kallisto tidak hanya cepat tetapi juga sangat akurat. Di banyak tolok ukur, bahkan sangat mengungguli alat yang ada.
Fitur
- Menggunakan pseudoalignment
- Cepat dan akurat
- RNA-Seq massal terukur dapat dianalisis dengan detektif
- Dapat digunakan dengan bustools untuk pra-proses data RNA-seq sel tunggal
Bahasa Pemrograman
C
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
