Ini adalah aplikasi Linux bernama MSL untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai mslib-1.1.0.9.tgz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi bernama MSL ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
MSL untuk dijalankan di Linux online
Ad
DESKRIPSI
MSL adalah pustaka C++ yang memungkinkan studi komputasi makromolekul.Pustaka MSL bukanlah program (walaupun beberapa aplikasi didistribusikan) tetapi alat bagi ilmuwan untuk mengkode metode pemodelan molekul mereka sendiri.
filsafat
Tujuan utamanya adalah untuk membuat seperangkat alat yang memungkinkan studi komputasi makromolekul dengan relatif mudah di semua tingkatan, dari operasi sederhana (misalnya, memuat PDB dan mengukur jarak atau mengedit dihedral) hingga aplikasi kompleks (pemodelan protein atau desain).
MSL dikembangkan di Senes Lab di University of Wisconsin-Madison dan oleh tim pengembang/pengguna dari laboratorium penelitian lain.
Referensi:
Kulp DW, Subramaniam S, Donald JE, Hannigan BT, Mueller BK, Grigoryan G, Senes A.
Informatika struktural, pemodelan, dan desain dengan Molecular Software Library (MSL) sumber terbuka.
Kimia Komputer J. 2012 vol. 33 halaman 1645-61
Unduh artikel di http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
Fitur
- Kemampuan menyimpan dan beralih di antara beberapa koordinat atom, untuk perubahan konformasi dan representasi rotamerik dari kebebasan konformasi rantai samping.
- Kemampuan untuk membangun dan menyimpan beberapa identitas residu (yaitu LEU, ILE, ALA) pada suatu posisi dan beralih di antara mereka.
- # Medan gaya CHARMM dan fungsi energi lainnya.
- Transformasi seperti translasi, rotasi, dan alignment.
- Algoritma pencarian seperti Monte Carlo, Dead End Elimination, dan Self Consistent Mean Field Monte Carlo., backbone sampling
- Generasi kisi kristal.
- Dukungan untuk perpustakaan rotamer
- Modifikasi dan generasi tulang punggung
- Platform yang didukung: Linux, MacOS
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
C + +
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/mslib/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
