Ini adalah aplikasi Linux bernama SuRankCo untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai surankco_r5.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama SuRankCo ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
SuRankCo untuk dijalankan di Linux online
Ad
DESKRIPSI
SuRankCo adalah perangkat lunak berbasis pembelajaran mesin untuk menilai dan memberi peringkat contigs dari rakitan de novo dari data pengurutan generasi berikutnya. Ini melatih dengan penyelarasan contigs dengan genom referensi yang diketahui dan memprediksi skor dan peringkat untuk contigs yang belum memiliki genom referensi terkait.Untuk detail lebih lanjut tentang SuRankCo dan fungsinya, silakan lihat
"SuRankCo: Peringkat Contig yang Diawasi di Majelis de novo"
Mathias Kuhring, Piotr Wojtek Dabrowski, Andreas Nitsche dan Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
PERHATIKAN, disarankan untuk membaca makalah dan file readme.txt sebelum menggunakan SuRankCo.
Pembaruan Juni2015:
* Perubahan kecil untuk mengaktifkan dukungan BAM.
Pembaruan Februari2014:
* Dukungan tambahan untuk rakitan FASTA/SAM selain ACE/FASTQ(QUAL).
CATATAN: fitur rakitan FASTA/SAM belum termasuk BaseCount, BaseSeqmentCount, dan ContigQualities.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Jawa, S/R
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/surankco/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
