Ini adalah aplikasi Windows bernama kSNP yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai kSNP4.1-source-code.zip. Itu dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama kSNP dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Mulai emulator online OS OnWorks apa pun dari situs web ini, tetapi emulator online Windows yang lebih baik.
- 5. Dari OS Windows OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Unduh aplikasi dan instal.
- 7. Unduh Wine dari repositori perangkat lunak distribusi Linux Anda. Setelah terinstal, Anda kemudian dapat mengklik dua kali aplikasi untuk menjalankannya dengan Wine. Anda juga dapat mencoba PlayOnLinux, antarmuka mewah di atas Wine yang akan membantu Anda menginstal program dan game Windows populer.
Wine adalah cara untuk menjalankan perangkat lunak Windows di Linux, tetapi tidak memerlukan Windows. Wine adalah lapisan kompatibilitas Windows sumber terbuka yang dapat menjalankan program Windows secara langsung di desktop Linux apa pun. Pada dasarnya, Wine mencoba untuk mengimplementasikan kembali Windows dari awal sehingga dapat menjalankan semua aplikasi Windows tersebut tanpa benar-benar membutuhkan Windows.
kSNP
Ad
DESKRIPSI
kSNP4 mengidentifikasi SNP pan-genom dalam serangkaian urutan genom, dan memperkirakan pohon filogenetik berdasarkan SNP tersebut. Penemuan SNP didasarkan pada analisis k-mer, dan tidak memerlukan penyelarasan beberapa urutan atau pemilihan genom referensi, sehingga kSNP4 dapat mengambil 100 genom mikroba sebagai masukan. Lokus SNP ditentukan oleh oligo dengan panjang k yang mengelilingi alel SNP pusat. kSNP4 dapat menganalisis genom lengkap (selesai) dan genom yang belum selesai dalam rangkaian rakitan atau pembacaan mentah dan belum dirakit. Genom yang sudah selesai dan belum selesai dapat dianalisis bersama-sama, dan kSNP dapat secara otomatis mengunduh file Genbank dari genom yang sudah selesai dan memasukkan informasi dalam file tersebut ke dalam anotasi SNP.
Tidak diperlukan keahlian pemrograman untuk menggunakan kSNP4
Gardner, SN dan Hall, BG 2013. . PLoS SATU, 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
Gardner, SN, T. Slezak, dan BG Hall. 2015 Bioinformatika 31: 2877-2878 doi: 10.1093/bioinformatika/btv271
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/ksnp/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
