Questo è il comando bowtie2-inspect-l che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
bowtie2-inspect-l: estrae informazioni da un indice bowtie2
SINOSSI
papillon2-inspect [Opzioni]*
DESCRIZIONE
Bowtie 2 versione 2.2.6 di Ben Langmead ([email protected], www.cs.jhu.edu/~langmea)
nome file bt2 meno .1.bt2l/.2.bt2l finale
Per impostazione predefinita, stampa i record FASTA delle sequenze nucleotidiche indicizzate sullo standard
fuori. Insieme a -n, stampa solo i nomi. Insieme a -s, stampa solo un riepilogo dell'indice
parametri e sequenze. Insieme a -e, conserva i colori se applicabile.
VERSIONI
-a/--attraverso
Numero di caratteri nell'output FASTA (predefinito: 60)
-n/--nomi
Stampa solo i nomi delle sequenze di riferimento
-s/--riepilogo
Stampa riepilogo incl. nomi di riferimento, lunghezze, proprietà dell'indice
-e//-bt2-ref
Ricostruisci il riferimento da .bt2l (lento, preserva i colori)
-v/--prolisso
Output dettagliato (per il debug)
-h/--aiuto
stampa una descrizione dettagliata dello strumento e delle sue opzioni
--Aiuto stampa questo messaggio di utilizzo
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