Questo è il comando bowtie2-inspect che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
bowtie2-inspect - wrapper per bowtie2-inspect-* index
SINOSSI
papillon2-inspect [Opzioni]*
DESCRIZIONE
Bowtie 2 versione 2.2.6 di Ben Langmead ([email protected], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 nome file meno finale .1.bt2/.2.bt2
Per impostazione predefinita, stampa i record FASTA delle sequenze nucleotidiche indicizzate sullo standard
fuori. Insieme a -n, stampa solo i nomi. Insieme a -s, stampa solo un riepilogo dell'indice
parametri e sequenze. Insieme a -e, conserva i colori se applicabile.
VERSIONI
--indice-grande
ispezione forzata dell'indice 'grande', anche se è presente uno 'piccolo'.
-a/--attraverso
Numero di caratteri nell'output FASTA (predefinito: 60)
-n/--nomi
Stampa solo i nomi delle sequenze di riferimento
-s/--riepilogo
Stampa riepilogo incl. nomi di riferimento, lunghezze, proprietà dell'indice
-e//-bt2-ref
Ricostruisci il riferimento da .bt2 (lento, conserva i colori)
-v/--prolisso
Output dettagliato (per il debug)
-h/--aiuto
stampa una descrizione dettagliata dello strumento e delle sue opzioni
--Aiuto stampa questo messaggio di utilizzo
Usa bowtie2-inspect online utilizzando i servizi onworks.net
