Questo è il comando fastq_quality_filter che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fastq_quality_filter - Filtra le sequenze in base alla qualità
DESCRIZIONE
utilizzo: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Parte di
FASTX Toolkit 0.0.14 di A. Gordon ([email protected])
[-h] = Questa utile schermata di aiuto.
[-q N] = Punteggio di qualità minimo da mantenere.
[-p N] = Percentuale minima di basi che devono avere qualità [-q].
[-z] = Comprimi l'output con GZIP.
[-i FILE]
= File di input FASTA/Q. l'impostazione predefinita è STDIN.
[-o OUTFILE] = file di output FASTA/Q. l'impostazione predefinita è STDOUT. [-v] = Verboso -
riportare il numero di sequenze.
Se viene specificato [-o],
il rapporto verrà stampato su STDOUT.
Se [-o] non è specificato (e l'output va a STDOUT), il rapporto verrà stampato su
STDERR.
Usa fastq_quality_filter online utilizzando i servizi onworks.net
