Questo è il comando fdnadiste che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fdnadist - Sequenza di acidi nucleici Programma matrice delle distanze
SINOSSI
fdnadista -sequenza seqsetall -metodo stratagemma -gamma stratagemma -ncategorie numero intero -Vota schieramento
-categorie proprietà [-pesi proprietà] -coefficiente gamma galleggiante
-invarfrac galleggiante -tratio galleggiante -freqda ginocchiera -frequenza base schieramento
[-inferiore booleano] [-leggibile dagli umani booleano] -file di uscita file di uscita [-dati di stampa booleano]
[-progresso booleano]
fdnadista -Aiuto
DESCRIZIONE
fdnadista è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Filogenesi:Sequenza molecolare".
VERSIONI
Ingresso pagina
-sequenza seqsetall
File contenente uno o più allineamenti di sequenza
-metodo stratagemma
Valore predefinito: modello distanza F84
-gamma stratagemma
Valore predefinito: nessun parametro di distribuzione utilizzato
-ncategorie numero intero
Valore predefinito: 1
-Vota schieramento
Valore predefinito: 1.0
-categorie proprietà
File delle categorie di tasso di sostituzione
-pesi proprietà
aggiuntivo pagina
-coefficiente gamma galleggiante
Valore predefinito: 1
-invarfrac galleggiante
Valore predefinito: 0.0
-tratio galleggiante
Valore predefinito: 2.0
-freqda ginocchiera
Valore predefinito: Sì
-frequenza base schieramento
Valore predefinito: 0.25 0.25 0.25 0.25
-inferiore booleano
Valore predefinito: N
-leggibile dagli umani booleano
Valore predefinito: @($(metodo)==s?Y:N)
Uscita pagina
-file di uscita file di uscita
-dati di stampa booleano
Valore predefinito: N
-progresso booleano
Valore predefinito: Sì
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