Questo è il comando fpromlke che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fpromlk - Filogenesi proteica per massima verosimiglianza
SINOSSI
fpromlk -sequenza seqsetall -intreefile albero [-ncategorie numero intero] -Vota schieramento
-categorie proprietà [-pesi proprietà] -lunghezze booleano [modello stratagemma]
[-gamma stratagemma] -coefficiente gamma galleggiante -gammacat numero intero -invarcoefficiente galleggiante
-ninvarcat numero intero -invarfrac galleggiante -nhmmcategorie numero intero -hmmrate schieramento
-hmmprobabilità schieramento -adjsite booleano -lambda galleggiante - confuso numero intero
semi numero intero -globale booleano [-fuori numero intero] -file di uscita file di uscita [-trota ginocchiera]
-outtreefile file di uscita [-dati di stampa booleano] [-progresso booleano] [-alberoprint booleano]
[-ipstato booleano]
fpromlk -Aiuto
DESCRIZIONE
fpromlk è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Filogenesi:Sequenza molecolare".
VERSIONI
Ingresso pagina
-sequenza seqsetall
File contenente uno o più allineamenti di sequenza
-intreefile albero
-ncategorie numero intero
Valore predefinito: 1
-Vota schieramento
-categorie proprietà
-pesi proprietà
aggiuntivo pagina
-lunghezze booleano
Valore predefinito: N
modello stratagemma
Valore predefinito: Jones-Taylor-Thornton
-gamma stratagemma
Valore predefinito: n
-coefficiente gamma galleggiante
Valore predefinito: 1
-gammacat numero intero
Valore predefinito: 1
-invarcoefficiente galleggiante
Valore predefinito: 1
-ninvarcat numero intero
Valore predefinito: 1
-invarfrac galleggiante
Valore predefinito: 0.0
-nhmmcategorie numero intero
Valore predefinito: 1
-hmmrate schieramento
Valore predefinito: 1.0
-hmmprobabilità schieramento
Valore predefinito: 1.0
-adjsite booleano
Valore predefinito: N
-lambda galleggiante
Valore predefinito: 1.0
- confuso numero intero
semi numero intero
Valore predefinito: 1
-globale booleano
Valore predefinito: N
-fuori numero intero
Uscita pagina
-file di uscita file di uscita
-trota ginocchiera
Valore predefinito: Sì
-outtreefile file di uscita
-dati di stampa booleano
Valore predefinito: N
-progresso booleano
Valore predefinito: Sì
-alberoprint booleano
Valore predefinito: Sì
-ipstato booleano
Valore predefinito: N
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