gdcm2vtk - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

gdcm2vtk - Converte un file supportato da VTK in DICOM.

SINOSSI

gdcm2vtk [opzioni] file-in file-out

DESCRIZIONE

I gdcm2vtk prende come input qualsiasi file supportato da VTK (incluso il file DICOM) e lo farà
generare come output un file DICOM.

PARAMETRI

file-in input nome file (supportato DICOM o VTK)

file-out nome file di output (supportato DICOM o VTK)

VERSIONI

specifico Opzioni
--force-rescale forza rescale.
--force-spacing forza spaziatura.
--palette-color quando supportato genera un file PALETTE COLOR.
--argb quando supportato genera un file ARGB.
--compress quando supportato genera un file compresso.
--use-vtkdicom Usa vtkDICOMImageReader (invece di GDCM).
--modalità impostata Modalità.
--lower-left imposta in basso a sinistra.
--shift imposta spostamento.
--scale imposta scala.
--compress set di compressione (MetaIO).
-T --study-uid Studio UID.
-S --series-uid UID di serie.
--root-uid UID radice.

compressione Opzioni
-J --jpeg Comprime l'immagine in jpeg.
-K --j2k Comprime l'immagine in j2k.
-L --jpegls Comprime l'immagine in jpeg-ls.
-R --rle Comprime l'immagine in rle (solo senza perdita di dati).

generale Opzioni
-h --aiuto
stampa questo testo di aiuto ed esci

-v --versione
stampa le informazioni sulla versione ed esci

-V --verboso
modalità dettagliata (avviso+errore).

-W --avviso
modalità di avviso, stampa informazioni di avviso

-E --errore
modalità errore, stampa informazioni sull'errore

-D --debug
modalità di debug, stampa informazioni di debug

ambiente variabile
GDCM_ROOT_UID UID radice

DESCRIZIONE

Converti un file supportato da VTK in DICOM.

L'uso tipico è:

$ gdcm2vtk file di input output.dcm

Utilizza il meccanismo di fabbrica interno di VTK per riconoscere un file (funzione CanRead). Vedere
File supportato VTK qui:

Quali formati di file immagine può leggere e scrivere VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Se il tuo file di input ha 4 componenti, il quarto comp (alpha) verrà rimosso dall'output
file poiché DICOM non supporta più il componente alfa (vedi opzione –argb).

Particolare attenzione è stata prestata al seguente formato di file:

1. DICOM: i coseni di direzione e vtkMedicalImageInformation vengono passati all'output
2. BMP: il file può essere salvato con una tabella di ricerca (vedi --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties viene passato all'output
4. MINC: il coseno di direzione viene passato all'uscita
5. TIFF: vtkTIFFReader è attualmente in cattive condizioni in VTK (comportamento diverso in VTK 5.2 e git/master). Usalo solo se sai cosa stai facendo.

CONVERTIRE MetaImmagine (mh, mah)
$ gdcm2vtk file di input output.mha

Questo comando convertirà il file DICOM di input: inputfile in un file MetaImage .mha. Stesso
va per il file .mhd.

CONVERTIRE MHA/MHD
$ gdcm2vtk file di input output.mha

or

$ gdcm2vtk file di input output.mhd

Questo comando convertirà il file DICOM di input: inputfile in un MetaImageData .mha/.mhd
file.

CONVERTIRE VTI
$ gdcm2vtk file di input output.vti

Questo comando convertirà il file DICOM di input: inputfile in un XML VTK ImageData .vti
file.

CONVERTIRE VTK
$ gdcm2vtk file di input output.vtk

Questo comando convertirà il file DICOM di input: inputfile in un vecchio VTK Structured
File .vtk di PointSet.

CONVERTIRE DICOM

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCMImageReader verrà utilizzato per leggere un file DICOM, non quello predefinito
vtkDICOMImageReader. Vedere l'opzione –use-vtkdicom per utilizzare vtkDICOMImageReader.

ANDATA E RITORNO DICOM A MHD A DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modalità USA --imageformat 7 output.mhd output.dcm

La sezione di riferimento sopra mostra come convertire un DICOM utilizzando l'interpretazione fotometrica di
YBR_FULL (o anche YBR_FULL_422 è con perdita) in un altro formato di file: MetaImage (mhd). Da quando
questo formato di file non gestisce lo spazio colore, dobbiamo impostarlo esplicitamente usando il
–imageformat opzione della riga di comando. L'opzione della riga di comando –modalità è richiesta in questo
caso poiché la famiglia di classi di archiviazione delle immagini di acquisizione secondaria predefinita non consente YBR
Interpretazione fotometrica.

GDCM2VTK NOTE

NOTA IMPORTANTE: La struttura VTK interna verrà riempita dall'ingresso DICOM, quindi
passare al writer DICOM di output. Alcune informazioni potrebbero andare perse durante la conversione
DICOM a VTK a DICOM. Questa opzione è usata principalmente per testare il
combinazione vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter.

NOTA IMPORTANTE: durante la conversione da un formato con perdita di dati come JPEG, le informazioni di
la perdita è importante. L'output DICOM conterrà l'immagine Lossy richiesta
Attributo di compressione che indica che l'immagine è stata compressa con perdita da qualche parte lungo il
tubatura. Vedi anche gdcmimg (migliore gestione di JPEG in generale).

NOTA IMPORTANTE: quando si utilizza –use-vtkdicom il file DICOM di output verrà sempre scritto come
MR Image Storage poiché queste informazioni non sono disponibili dal lettore stesso. Questo permette
impostare correttamente l'orientamento dell'immagine (paziente).

Usa gdcm2vtk online utilizzando i servizi onworks.net