gmx-eneconv - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

gmx-eneconv - Converti file energetici

SINOSSI

gmx eneconv [-f [<.edr> […]]] [-o [<.edr>]] [-b ] [-e ]
[-DT ] [-compensare ] [-[no]l'ora stabilita] [-[nessuna] specie]
[-[no]rmdh] [-scalefac ] [-[nessun errore]

DESCRIZIONE

Con multiplo file specificato per il -f opzione:

Concatena diversi file di energia in ordine ordinato. In caso di tempi doppi, il
viene utilizzato uno nel file successivo. Specificando -tempo impostato ti verrà chiesta l'ora di inizio
di ogni file. I file di input sono presi dalla riga di comando, in modo che il comando gmx
eneconv -f *.edr -o fisso.edr dovrebbe fare il trucco

Con prima filetto specificato per -f:

Legge un file di energia e ne scrive un altro, applicando il -DT, -compensare, -t0 ed -tempo impostato
opzioni e conversione in un formato diverso se necessario (indicato dalle estensioni dei file).

-tempo impostato viene applicato prima, poi -DT/-compensare seguito da -b ed -e per selezionare quali fotogrammi
scrivere.

VERSIONI

Opzioni per specificare i file di input:

-f [<.edr> […]] (energ.edr)
File di energia

Opzioni per specificare i file di output:

-o [<.edr>] (fisso.edr)
File di energia

Altre opzioni:

-b (-1)
Prima volta da usare

-e (-1)
L'ultima volta da usare

-DT (0)
Scrivere frame solo quando t MOD dt = offset

-compensare (0)
Differenza oraria per -DT opzione

-[no]l'ora stabilita (In)
Modifica l'ora di inizio in modo interattivo

-[nessuna] specie (sì)
Ordina file energetici (non fotogrammi)

-[no]rmdh (In)
Rimuovere i dati del blocco energetico gratuito

-scalefac (1)
Moltiplica la componente energetica per questo fattore

-[nessun errore (sì)
Interrompi su errori nel file

NOTO PROBLEMI

· Quando si combinano le traiettorie, il sigma e E^2 (necessario per le statistiche) non vengono aggiornati
correttamente. Solo l'energia effettiva è corretta. Si deve quindi calcolare le statistiche in
un altro modo.

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