Questo è il comando hmm2fetch che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
hmm2fetch: recupera un HMM da un database HMM
SINOSSI
hmm2fetch [opzioni] banca dati Nome
DESCRIZIONE
hmm2fetch è una piccola utility che recupera un HMM chiamato Nome da un database di modelli HMMER
detto Banca dati. in un nuovo formato e stampa quel modello sullo standard output. Per esempio,
hmm2fetch Pfam RRM recupera il modello RRM (motivo di riconoscimento dell'RNA) da Pfam, se il
la variabile di ambiente HMMERDB è impostata sulla posizione del database Pfam. Il recuperato
Il file HMM è scritto in formato ASCII HMMER 2.
Il database deve avere un file indice GSI associato. Per indicizzare un database HMM, utilizzare il pulsante
Programma hmm2indice.
VERSIONI
-h Stampa breve guida; include il numero di versione e il riepilogo di tutte le opzioni, incluso
opzioni per esperti.
-n Interpretare Nome come un numero HMM invece di un nome. La numerazione inizia da 0. Per
esempio, per recuperare il primo HMM da un database HMM chiamato pippo, faresti
hmm2fetch -n 0 pippo.
Usa hmm2fetch online utilizzando i servizi onworks.net
