Questo è il comando indigo-cano che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
indigo-cano - produce SMILES canonici o codice a strati per molecole in formato MOL o SDF
SINOSSI
indaco-cano nomefile.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [parametri]
indaco-cano - SORRISI [parametri]
DESCRIZIONE
indaco-cano viene utilizzato per produrre SMILES canonici o codice a strati per molecole in MOL o
formato SDF.
VERSIONI
indaco-cano si aspetta un file o un codice SMILES sullo standard input, che quindi potrebbe essere
seguito da uno o più dei seguenti parametri.
-sorrisi
Output SMILES canonici (predefinito)
-a strati
Output codice a strati canonico
-ID
Campo ID con il nome dato in un file SDF
-no-aroma
Non aromatizzare le molecole
-no-tetraedrico
Ignora gli stereocentri tetraedrici
-no-cistrani
Ignora le informazioni sui legami cis-trans
ESEMPI
indaco-cano file.sdf
indaco-cano infile.sdf.gz -ID molregno > risultati.txt
indaco-cano infile.smi -a strati -no-cistrani
indaco-cano - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
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