Questo è il comando maf2anchors.pl che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
maf2anchors -- converte i file maf in set di ancoraggi Murasaki
SINOSSI
maf2ancora
VERSIONI
--prefisso=
usa come prefisso per i nomi dei file di output (altrimenti usa )
--rift=
permettere fino a spaccature.
--fakeseq
generare file di lunghezza della sequenza falsi e stub di sequenza basati sui dati di lunghezza della sequenza
nel file MAF
--fiducia
fidati dell'annotazione del commento aggiunta da TBA sulla seconda riga del file (se presente)
che elenchi l'albero utilizzato nell'allineamento e tutte le sequenze coinvolte. Predefiniti
su. usa --notrust per diffidare dei tag TBA (tecnicamente questi dati non fanno parte del
specifica del formato del file ed è solo stipato nei commenti prodotti da TBA, ma
potrebbe non essere presente o preciso su tutti i file MAF, quindi ti diamo la possibilità di
diffidare).
--ordinare
Ordina le sequenze trovate da --trust (in modo da abbinare l'output che avrebbe
è successo con --notrust).
Usa maf2anchors.pl online utilizzando i servizi onworks.net