Questo è il comando masai_output_pe che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
masai_output_pe - Output Masai - Modalità Paired End
SINOSSI
masai_output_pe [OPZIONI]
DESCRIZIONE
Masai è un mappatore di lettura veloce e preciso basato su semi approssimativi e multipli
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See http://www.seqan.de/projects/masai per maggiori informazioni.
(c) Copyright 2011-2012 di Enrico Siragusa.
-h, --Aiuto
Visualizza questo messaggio di aiuto.
--versione
informazioni sulla versione
Opzioni di abbinamento:
-ng, --no-gap
Non allineare le letture con gli spazi.
-LL, --libreria-lunghezza NUM
Lunghezza della libreria. Valore predefinito: 220.
-Le, --library-errore NUM
Tolleranza sulla lunghezza della libreria. Valore predefinito: 50.
Opzioni di uscita:
-t, --cartella-tmp STR
Specifica una grande cartella temporanea. Predefinito: usa la cartella del genoma.
-o, --file di uscita RISORSE
Specifica un file di output. Predefinito: usa il prefisso del nome del file reads. Tipi di file validi
sono: crudo e sam.
-nc, --no-sigaro
Non emettere la stringa CIGAR. Ciò riguarda solo l'output SAM.
Opzioni di debug:
-ns, --nessuna discarica
Non scaricare i risultati.
VERSIONE
masai_output_pe versione: 0.7.1 [14053] Ultimo aggiornamento 2013/05/16
Usa masai_output_pe online utilizzando i servizi onworks.net
