mia-2dmyocard-ica - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-2dmyocard-ica - Esegui un'analisi ICA su una serie di immagini 2D

SINOSSI

mia-2dmyocard-ica -i [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-2dmyocard-ica Questo programma viene utilizzato per eseguire un ICA su una serie di perfusione miocardica
immagini per creare riferimenti sintetici che possono essere utilizzati per la correzione del movimento per immagine
registrazione. Se l'obiettivo è eseguire una compensazione completa del movimento, allora è meglio creare
un set di segmentazione e usa mia-2dmyoica-nonrigid. Se i dati di input sono forniti mediante a
segmentation set, quindi su può anche usare mia-2dmyocard-icaseries. Questo programma è
essenzialmente utilizzato per testare diverse opzioni su come eseguire l'immagine di riferimento ICA
creazione.

VERSIONI

-i --in-base=(input, richiesto); io
inserire il nome del file di collegamento al nome del modelloXXXX.ext X=numeri Per i file supportati
tipi vedi PLUGIN:2dimage/io

--coef=
coefficienti di miscelazione in uscita su questo file

-o --out-base=(output); corda
base del nome del file di output

-t --tipo=esr
tipo di file di output
supportato valori sono:( @, BMP, DCM, ESR, jpg, JPG, PNG, CRUDO,
TIFF, TIPO, V, VISUALIZZA, bpm, cmq, exr, jpg, jpg, PNG, crudo, tif,
battibecco, v, vista, )

-k --salta=2
salta le immagini all'inizio della seriesalta le immagini all'inizio della serie

-e --fine=60
ultima immagine della serieultima immagine della serie

-C --componenti=0
nr. di componenti, 0=stima automaticamente nr. di componenti, 0=stima
automaticamente

-m --striscia-media
rimuovere l'immagine media dalla serie

-f --save-features=
salva immagine caratteristica

-p --strip-periodico
strip solo componente periodico

-x --max-ica-iterazioni=0
iterazioni max risolutore ICA iterazioni max risolutore ICA

-n --ica-normalizza
ica_normalize immagini in primo piano

--all-feature=
salva tutte le immagini in primo piano in

-L --LV-crop-amp=0
Amplificazione maschera di ritaglio LV, 0.0 = non ritagliare Amplificazione maschera di ritaglio LV, 0.0
= non ritagliare

-a --auto-componenti
stima automatica del numero di componenti in base alla correlazione. Implica
-m e -n (sperimentale)

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

PLUGIN: immagine 2d/io

bmp Supporto per input/output di immagini 2D BMP

Estensioni file riconosciute: .BMP, .bmp

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

dicom Immagine 2D io per DICOM

Estensioni file riconosciute: .DCM, .dcm

Tipi di elementi supportati:
16 bit con segno, 16 bit senza segno

EXR un plugin io 2dimage per immagini OpenEXR

Estensioni file riconosciute: .EXR, .exr

Tipi di elementi supportati:
32 bit senza segno, 32 bit in virgola mobile

jpg un plugin io 2dimage per immagini jpeg in scala di grigi

Estensioni file riconosciute: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno

png un plugin io 2dimage per immagini png

Estensioni file riconosciute: .PNG, .png

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno

crudo Supporto per l'output di immagini 2D RAW

Estensioni file riconosciute: .RAW, .raw

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

tif Supporto ingresso/uscita immagini TIFF 2D

Estensioni file riconosciute: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno, 32 bit senza segno

vista un plugin io 2dimage per le immagini di vista

Estensioni file riconosciute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

ESEMPIO

Valuta i riferimenti sintetici dalle immagini imageXXXX.exr e salvali in refXXXX.exr
utilizzando cinque componenti indipendenti, significa rimuovere, normalizzare e saltare 2 immagini.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

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con ASSOLUTAMENTE NESSUNA GARANZIA e puoi ridistribuirlo secondo i termini della GNU
LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

Usa mia-2dmyocard-ica online utilizzando i servizi onworks.net