mia-2dsegseriesstats - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-2dsegseriesstats - Valuta le curve di intensità del tempo nelle regioni mascherate delle serie di immagini.

SINOSSI

mia-2dsegseriesstats -o -g [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-2dsegseriesstats Questo programma viene utilizzato per valutare varie curve di intensità di tempo su a
serie di immagini date da un insieme di segmentazione. In particolare, il programma è personalizzato per
valutare le intensità medie e le variazioni delle sezioni del miocardio del ventricolo sinistro. Il
il set di segmentazione deve contenere le segmentazioni per tutte le sezioni a cui si accederà
durante la valutazione.

VERSIONI

-o --original=(input, richiesto); corda
set di segmentazione originale

-g --registered=(input, richiesto); corda
insieme di segmentazione registrato

-k --salta=2
immagini da saltare all'inizio della serie, se (k < 0) si usa il picco RV del
set registrato se imposta immagini da saltare all'inizio della serie, se (k < 0)
utilizzare il picco RV del set registrato se impostato

-r --riferimento=-1
quadro di riferimento per l'estrazione automatica della curva. È possibile utilizzare valori negativi
per indicare valori specifici (se forniti nel set di segmentazione):
-3: Metà della serie
-2: riferimento preferito
-1: picco LV se uno dei precedenti non è disponibile o il valore è < -3,
usa l'ultimo frame della serie. frame di riferimento per la curva automatica
estrazione. I valori negativi possono essere utilizzati per indicare valori specifici (se
dato nel set di segmentazione):
-3: Metà della serie
-2: riferimento preferito
-1: picco LV se uno dei precedenti non è disponibile o il valore è < -3,
utilizzare l'ultimo fotogramma della serie.

-c --curve=(uscita); corda
curve del valore medio della regione, i file di output comprendono ciascuno una tabella in
formato di testo normale che contiene tre colonne per ogni sezione del LV
miocardio: La prima colonna contiene i valori ottenuti utilizzando il
segmentazione originale del riferimento su tutte le immagini della serie originale,
la seconda colonna contiene i valori ottenuti dal registrato
segmentazione del riferimento su tutte le immagini della serie registrata, e
la terza colonna contiene i valori ottenuti utilizzando le segmentazioni di
ogni fetta sulle immagini originali.

-v --varcurves=(output); corda
valori di variazione della regione, stesso formato come descritto sopra.

-n --nsezioni=0
numero di sezioni da utilizzare, 0=usa come segmentato, altrimenti Altrimenti, il LV
il miocardio è diviso in n sezioni che racchiudono angoli uguali a partire da
il punto di inserimento del ventricolo destro muovendosi in senso orario usando il centro LV come
punto angolare.numero di sezioni da usare, 0=usa come segmentato, altrimenti
In caso contrario, il miocardio LV è diviso in n sezioni che racchiudono uguali
angoli a partire dal punto di inserimento del ventricolo destro che si sposta in senso orario
usando il centro LV come punto angolare.

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

ESEMPIO

Valutare le due curve digitate per 12 sezioni dai set di segemntazione orig.set e reg.set
saltando i primi 2 fotogrammi. L'output verrà scritto su curves.txt e varcurves.txt
rispettivamente.

mia-2dsegseriesstats -i org.set -g reg.set -c curve.txt -v varcurves.txt -n 12 -k 2

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

Questo software è protetto da Copyright (c) 1999‐2015 Lipsia, Germania e Madrid, Spagna. Viene
con ASSOLUTAMENTE NESSUNA GARANZIA e puoi ridistribuirlo secondo i termini della GNU
LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

Usa mia-2dsegseriesstats online utilizzando i servizi onworks.net