mia-3dcost-translatedgrad - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-3dcost-translatedgrad - Valuta il gradiente di costo tra due immagini e convertilo
a una rappresentazione spline.

SINOSSI

mia-3dcost-translatedgrad -i -r -o [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-3dcost-translatedgrad Valuta il gradiente di costo tra due immagini e valuta il
gradiente relativo alla trasformazione per esso basato sul modello di trasformazione dato.

VERSIONI

-i --in-file=(input, richiesto); io
input image Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-file=(input, richiesto); io
immagine di riferimento Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dimage/io

-o --out-file=(output, richiesto); io
campo del vettore di output Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dtransform/io

-g --gradimg-file=(output); io
immagine standard del gradiente trasformato spline Per i tipi di file supportati vedere
PLUGIN:3dimage/io

-C --cost-gradimg-file=(output); io
immagine standard del gradiente di costo Per i tipi di file supportati vedere
PLUGIN:3dimage/io

-f --transForm=spline:velocità=5
Trasformazione a cui si riferisce il gradiente Trasformazione a cui si riferisce il gradiente
Per i plugin supportati vedi PLUGINS:3dimage/transform

-c --costo=ssd
funzione di costo da utilizzarefunzione di costo da utilizzare Per i plugin supportati vedere
PLUGIN:3dimage/costo

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

PLUGIN: 1g/splinebc

specchio Condizioni al contorno di interpolazione spline che si specchiano sul confine

(nessun parametro)

ripetere Condizioni al contorno dell'interpolazione spline che ripete il valore al confine

(nessun parametro)

zero Condizioni al contorno di interpolazione spline che assumono zero per valori esterni

(nessun parametro)

PLUGIN: 1d/splinekernel

bspline Creazione del kernel B-spline, i parametri supportati sono:

d = 3; intero in [0, 5]
Grado spline.

mamme Creazione del kernel OMoms-spline, i parametri supportati sono:

d = 3; intero in [3, 3]
Grado spline.

PLUGIN: 3dimage/costo

lncc correlazione incrociata normalizzata locale con supporto mascheramento., parametri supportati
siamo:

w = 5; unint in [1, 256]
metà larghezza della finestra utilizzata per valutare la croce localizzata
correlazione.

mi Informazioni reciproche basate su parzen spline., i parametri supportati sono:

taglio = 0; fluttuare in [0, 40]
Percentuale di pixel da tagliare ad alta e bassa intensità da rimuovere
valori anomali.

bin = 64; unint in [1, 256]
Numero di contenitori dell'istogramma utilizzati per l'immagine in movimento.

mkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
Kernel spline per hinstogram parzen di immagini in movimento. Per i plug-in supportati
vedi PLUGIN:1d/splinekernel

rbin = 64; unint in [1, 256]
Numero di bin dell'istogramma utilizzati per l'immagine di riferimento.

kernel = [bspline:d=0]; fabbrica
Kernel spline per l'hinstogram parzen dell'immagine di riferimento. Per i plug-in supportati
ins vedi PLUGINS:1d/splinekernel

ncc correlazione incrociata normalizzata.

(nessun parametro)

ngf Questa funzione valuta la somiglianza dell'immagine in base al gradiente normalizzato
campi. Dati i campi gradiente normalizzati $ _S$ dell'immagine src e $ _R$ del
ref image sono implementati vari valutatori., i parametri supportati sono:

eval = ds; detto
sottotipo di plugin (sq, ds, dot, cross). I valori supportati sono:
ds ‐ quadrato della differenza in scala
punto ‐ kernel prodotto scalare
attraversare ‐ kernel prodotto incrociato

ssd Costo immagine 3D: somma delle differenze al quadrato, i parametri supportati sono:

autotreccia = 0; fluttuare in [0, 1000]
Usa il mascheramento automatico dell'immagine in movimento prendendo solo i valori di intensità
conto che sono maggiori della soglia data.

norma = 0; bollo
Imposta se la metrica deve essere normalizzata per il numero di pixel dell'immagine.

ssd-maschera automatica
Costo dell'immagine 3D: somma delle differenze al quadrato, con mascheramento automatico basato su un dato
soglie, i parametri supportati sono:

trebbiare = 0; Doppio
Valore di soglia dell'intensità per l'immagine di riferimento.

strillare = 0; Doppio
Valore di soglia dell'intensità per l'immagine sorgente.

PLUGIN: immagine 3d/io

analizzare Analizza immagine 7.5

Estensioni file riconosciute: .HDR, .hdr

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno, 32 bit con segno, 32 bit con virgola mobile,
virgola mobile 64 bit

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

dicom Serie di immagini Dicom in 3D

Estensioni file riconosciute: .DCM, .dcm

Tipi di elementi supportati:
16 bit con segno, 16 bit senza segno

hdf5 I/O immagine 5D HDF3

Estensioni file riconosciute: .H5, .h5

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, flottante
punto 32 bit, virgola mobile 64 bit

inria immagine INRIA

Estensioni file riconosciute: .INR, .inr

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

mhd Immagine MetaIO 3D IO utilizzando l'implementazione VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

elegante NIFTI-1 immagine 3D IO

Estensioni file riconosciute: .NII, .nii

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, virgola mobile 32
bit, virgola mobile 64 bit

vff VFF Sun formato raster

Estensioni file riconosciute: .VFF, .vff

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno

vista vista 3D

Estensioni file riconosciute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

VTI Immagine 3D VTK-XML in entrata e in uscita (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTI, .vti

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

vk Ingresso e uscita legacy dell'immagine 3D VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

PLUGIN: 3dimage/trasformare

raffinato Trasformazione affine (12 gradi di libertà), i parametri supportati sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

asserot Trasformazione di rotazione ristretta (1 gradi di libertà). La trasformazione è
limitato alla rotazione attorno all'asse dato intorno alla rotazione data
center, i parametri supportati sono:

asse =(richiesto, vettore 3df)
asse di rotazione.

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

origine =(richiesto, vettore 3df)
centro della trasformazione.

raffinato Trasformazione affine ristretta (3 gradi di libertà). La trasformazione è
limitato alla rotazione attorno all'asse dato e al taglio lungo i due assi
perpendicolare a quello indicato, i parametri supportati sono:

asse =(richiesto, vettore 3df)
asse di rotazione.

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

origine =(richiesto, vettore 3df)
centro della trasformazione.

rigido Trasformazione rigida, cioè rotazione e traslazione (sei gradi di libertà).,
i parametri supportati sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

origine = [[0,0,0]]; vettore 3df
Centro di rotazione relativo, cioè <0.5,0.5,0.5> corrisponde al centro di
il volume.

rotazione Trasformazione di rotazione (tre gradi di libertà)., i parametri supportati sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

origine = [[0,0,0]]; vettore 3df
Centro di rotazione relativo, cioè <0.5,0.5,0.5> corrisponde al centro di
il volume.

piegarsi Trasformazione ristretta (4 gradi di libertà). La trasformazione è
limitato alla rotazione attorno all'asse x e y e una flessione lungo l'x
asse, indipendente in ogni direzione, con la flessione crescente con il
distanza al quadrato dall'asse di rotazione., i parametri supportati sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

norot = 0; bollo
Non ottimizzare la rotazione.

origine =(richiesto, vettore 3df)
centro della trasformazione.

spline Trasformazione a forma libera che può essere descritta da un insieme di coefficienti B-spline
e un kernel B-spline sottostante., i parametri supportati sono:

anisorare = [[0,0,0]]; vettore 3df
coefficiente anisotropico in pixel, i valori non positivi saranno
sovrascritto dal valore 'tasso'..

mettere a punto = 0; bollo
abilitare l'output di debug aggiuntivo.

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

Kernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel spline di trasformazione. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

pena = ; fabbrica
termine di energia di pena di trasformazione. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:3dtransform/splinepenalty

tasso = 10; fluttuare in [1, inf)
coefficiente isotropo in pixel.

tradurre Traduzione (tre gradi di libertà), i parametri supportati sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

vf Questo plug-in implementa una trasformazione che definisce una traduzione per ciascuno
punto della griglia che definisce il dominio della trasformazione., supportato
i parametri sono:

confine = specchio; fabbrica
condizioni al contorno dell'interpolazione dell'immagine. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabbrica
kernel dell'interpolatore di immagini. Per i plug-in supportati vedere
PLUGIN:1d/splinekernel

PLUGIN: 3dtrasformare/io

bbs IO serializzato binario (non portatile) di trasformazioni 3D

Estensioni di file riconosciute: .bbs

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

vista Archiviazione Vista di trasformazioni 3D

Estensioni file riconosciute: .v, .v3dt

xml IO serializzato XML di trasformazioni 3D

Estensioni file riconosciute: .x3dt

PLUGIN: 3dtrasformazione/splinepenalità

divcurl divcurl penalità sulla trasformazione, i parametri supportati sono:

arricciare = 1; fluttuare in [0, inf)
peso di penalità sul curl.

div = 1; fluttuare in [0, inf)
peso della penalità sulla divergenza.

norma = 0; bollo
Impostato a 1 se la penalità deve essere normalizzata rispetto all'immagine
dimensione.

peso = 1; fluttuare in (0, inf)
peso dell'energia della penalità.

ESEMPIO

Valuta il costo SSD tra src.v e ref.v e memorizza il gradiente di gradiente
corrispondente a una trasformazione spline in grad.v3dt.

mia-3dcost-translatedgrad -i src.v -o grad.v3dt -f spline:rate=8 -c ssd

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

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con ASSOLUTAMENTE NESSUNA GARANZIA e puoi ridistribuirlo secondo i termini della GNU
LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

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