Questo è il comando uc-echo che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
uc-echo - Correzione errori di lettura breve
SINOSSI
uc-eco [Opzioni] leggi_nome_file
VERSIONI
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-o OUTPUT_NOMEFILE, --produzione=OUTPUT_NOMEFILE
Nome del file di output
-l LOG_NOMEFILE, --tronco d'albero=LOG_NOMEFILE
Nome del file di registro
--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
Directory dati temporanea
-u NCPU, --ncpu=NCPU
Numero di processi utilizzati nella formazione
-b TAGLIA, --misura del blocco=DIMENSIONE B
Dividi i dati in blocchi di dimensioni specificate
--nh=NASH, --n_hash_block=NASH
Dividi la tabella hash in n tabelle
--rm=LEGGI_MERGE, --read_merge_size=LEGGI_MERGE
Unisci n tabelle hash alla volta
--hm=HASH_MERGE, --hash_merge_batch_size=HASH_MERGE
Unisci elenchi di adiacenze alla volta
-k K, --Kmer=K
dimensione k-mer utilizzata per l'hashing
-e E, --min_tolleranza_errore=E
Tolleranza di errore minima per la ricerca dei parametri
-E E, --max_tolleranza_errore=E
Tolleranza di errore massima per la ricerca dei parametri
--hh=H, --min_minimo_sovrapposizione=H
Lunghezza minima minima di sovrapposizione per la ricerca dei parametri
--hH=H, --max_minimo_sovrapposizione=H
Lunghezza minima di sovrapposizione massima per la ricerca dei parametri
--h_rate=TASSO_H, --eterozygous_rate=TASSO_H
Tasso per sito eterozigote
--dimensione_selezione_modello=MISURA
Dimensione del set di dati per la selezione del modello
--keep_all_files
Conserva tutti i file temporanei. Per impostazione predefinita, i file temporanei vengono eliminati automaticamente.
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-o OUTPUT_NOMEFILE, --produzione=OUTPUT_NOMEFILE
Nome del file di output
-l LOG_NOMEFILE, --tronco d'albero=LOG_NOMEFILE
Nome del file di registro
--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
Directory dati temporanea
-u NCPU, --ncpu=NCPU
Numero di processi utilizzati nella formazione
-b TAGLIA, --misura del blocco=DIMENSIONE B
Dividi i dati in blocchi di dimensioni specificate
--nh=NASH, --n_hash_block=NASH
Dividi la tabella hash in n tabelle
--rm=LEGGI_MERGE, --read_merge_size=LEGGI_MERGE
Unisci n tabelle hash alla volta
--hm=HASH_MERGE, --hash_merge_batch_size=HASH_MERGE
Unisci elenchi di adiacenze alla volta
-k K, --Kmer=K
dimensione k-mer utilizzata per l'hashing
-e E, --min_tolleranza_errore=E
Tolleranza di errore minima per la ricerca dei parametri
-E E, --max_tolleranza_errore=E
Tolleranza di errore massima per la ricerca dei parametri
--hh=H, --min_minimo_sovrapposizione=H
Lunghezza minima minima di sovrapposizione per la ricerca dei parametri
--hH=H, --max_minimo_sovrapposizione=H
Lunghezza minima di sovrapposizione massima per la ricerca dei parametri
--h_rate=TASSO_H, --eterozygous_rate=TASSO_H
Tasso per sito eterozigote
--dimensione_selezione_modello=MISURA
Dimensione del set di dati per la selezione del modello
--keep_all_files
Conserva tutti i file temporanei. Per impostazione predefinita, i file temporanei vengono eliminati automaticamente.
Usa uc-echo online utilizzando i servizi onworks.net
