Questa è l'app Linux denominata crossmap la cui ultima versione può essere scaricata come v0.6.5.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata crossmap con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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mappa incrociata
DESCRIZIONE
CrossMap è un programma per convertire comodamente le coordinate del genoma e i file di annotazione del genoma tra gli assembly (es. lift da GRCh36/hg18 a GRCh37/hg19 o viceversa). Supporta file in formato BAM, SAM, BED, Wiggle, BigWig, GFF, GTF .
Caratteristiche
- Conversione delle coordinate del genoma tra gli assiemi
- Supporta il formato di input BAM, SAM, BigWig, Wiggle, BED, VCF
- Esegui su Linux, Mac OS
Pubblico
Scienza/Ricerca, Istruzione, Ingegneria
Linguaggio di programmazione
pitone, do
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/crossmap/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.