Questa è l'app Linux denominata FASTQSim, eseguibile online su Linux. La sua ultima versione può essere scaricata come FASTQsim_v2.0.tgz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata FASTQSim per eseguirla gratuitamente online su Linux con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
FASTQSim verrà eseguito online su Linux
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DESCRIZIONE
FASTQSim è uno strumento che fornisce la doppia funzionalità di caratterizzazione di dataset di sequenziamento di nuova generazione e generazione di dati metagenomici.FASTQSim è un sequenziamento indipendente dalla piattaforma e calcola le distribuzioni della lunghezza di lettura, i punteggi di qualità, i tassi di indel, i tassi di mutazione a punto singolo, la dimensione di indel e statistiche simili per qualsiasi sequenziamento
piattaforma. Per creare set di dati di addestramento o test, FASTQSim ha la capacità di convertire le sequenze di destinazione in letture in silico con corrispondenza
profili di errore
FASTQsim consente all'utente di simulare singoli set di dati di lettura che possono essere utilizzati come scenari di test standardizzati per la pianificazione di progetti di sequenziamento o per il benchmarking del software metagenomico. A questo proposito, i set di dati in silico generati con lo strumento FASTQsim presentano diversi vantaggi rispetto ai set di dati naturali: sono indipendenti dalla piattaforma di sequenziamento, estremamente ben caratterizzati e meno costosi da generare.
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
