Questa è l'app Linux denominata Just_Preprocess_My_Reads la cui ultima versione può essere scaricata come justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Just_Preprocess_My_Reads con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Just_Preprocess_My_Reads
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DESCRIZIONE
Identifica rRNA, contaminanti, tagli in modo standard, ecc. Mantiene le coppie di lettura. Creato per progetti ad alto throughput (terabyte di dati).
Utilizza pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (opzionale)
Caratteristiche
- illumina pre-elaborazione
- controllo della contaminazione
Pubblico
Scienza / Ricerca
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.