Si tratta dell'app Linux denominata Just_Preprocess_My_Reads, la cui ultima versione può essere scaricata come justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Just_Preprocess_My_Reads con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Preelabora solo le mie letture
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DESCRIZIONE
Identifica rRNA, contaminanti, trim in modo standard, ecc. Mantiene le coppie di lettura. Progettato per progetti ad alta produttività "fire-and-forget" (terabyte di dati).
Utilizza pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (facoltativo)
Caratteristiche
- pre-elaborazione illumina
- controllo della contaminazione
Pubblico
Scienza / Ricerca
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
