Questa è l'app Linux denominata multipsq da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come multiPSQ_1.1.0_linux_x86_32.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata multipsq per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
multipsq per l'esecuzione in Linux online
DESCRIZIONE
Un software per la classificazione degli organismi in base ai risultati di algoritmi di multiplex pyrosequencing eseguiti sul Pyro-Mark ID System (Qiagen). I test possono essere progettati utilizzando il software mpsqed disponibile da https://sourceforge.net/projects/mpsqed/Il pirosequenziamento può essere applicato per la tipizzazione del patogeno basata sul polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) o per fornire informazioni sulla sequenza di brevi tratti di DNA. Tuttavia, per alcuni agenti patogeni la tipizzazione molecolare non può essere eseguita basandosi su un singolo SNP o su un breve tratto di sequenza, rendendo necessaria la considerazione di diverse regioni genomiche. Un promettente approccio rapido è l'applicazione simultanea di primer di sequenziamento multipli, chiamati multiplex pyrosequencing. Questi primer generano un pirogramma-impronta che è costituito dalla somma di tutti i singoli pirogrammi originati da ciascun primer utilizzato. MultiPSQ consente l'analisi e la classificazione di multiplex-pyrograms provenienti da vari primer di pirosequenziamento.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Qt
Linguaggio di programmazione
C++
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/multipsq/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.