Questa è l'app Linux denominata ParamIT da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come ParamITPack-1.0.tar.bz2. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata ParamIT per eseguirla gratuitamente in Linux online con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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ParamIT per funzionare in Linux online
DESCRIZIONE
ParamIT è un toolkit che aiuta lo sviluppo della parametrizzazione del campo di forza meccanica molecolare di piccole molecole simili a trascinamento all'interno del protocollo CHARMM General Force Field (CGenFF). Il toolkit sviluppato aiuta i ricercatori nei seguenti modi: 1) automatizzare la creazione di più file di input per programmi di meccanica quantistica e molecolare, 2) automatizzare l'analisi dell'output e 3) sostituire l'uso di programmi MM completi con uno specializzato più veloce. Gli strumenti sviluppati includono: 1) generatore di complessi molecola-acqua con interfaccia utente grafica (GUI), 2) analisi di frequenza semiautomatica utilizzando una matrice di distribuzione dell'energia potenziale simbolica e confronto di coordinate interne ottimizzate, 3) GUI per l'adattamento della carica con tre modalità : manuale, campionamento Monte-Carlo o forza bruta, e 4) GUI per l'adattamento dei termini diedri. L'utilizzo di questi strumenti riduce lo sforzo di manodopera, riduce gli errori di input manuale e riduce il tempo necessario per sforzi di parametrizzazione MM accurati.Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando, Tk
Linguaggio di programmazione
C, Pitone
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/paramit/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
